More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0438 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  692    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  47.7 
 
 		 348 aa  291  7e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  45.32 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  42.69 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  43.77 
 
 		 340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  40.78 
 
 		 352 aa  252  5.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  41.64 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  38.37 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  40.88 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  39.83 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  38.57 
 
 		 347 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  38.57 
 
 		 347 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  38.95 
 
 		 339 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  39.04 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  37.21 
 
 		 340 aa  215  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  38.95 
 
 		 351 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  38.57 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  39.37 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  38.18 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  35.14 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  42.45 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  38.21 
 
 		 356 aa  198  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  40.36 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  40.07 
 
 		 374 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  39.24 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  39.58 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  35.9 
 
 		 373 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  37.59 
 
 		 375 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  30.88 
 
 		 381 aa  169  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  32.08 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  34.87 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  39.91 
 
 		 222 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  32 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  32.77 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  37.77 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  28.22 
 
 		 531 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  35 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  35 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  31.73 
 
 		 380 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  33.24 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  31.14 
 
 		 347 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  31.49 
 
 		 405 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  33.45 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  27.44 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  30.18 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  28.09 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  30.92 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  33.92 
 
 		 251 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  26.02 
 
 		 571 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1622  phage integrase family protein  28.06 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1667  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  27.25 
 
 		 365 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  28.92 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.34 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  29.28 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.98 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.68 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1711  integrase family protein  25.84 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213299  hitchhiker  0.00000987295 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2435  integrase family protein  27.81 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.061585  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  25.22 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0798  integrase family protein  28 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000196141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0773  phage integrase family protein  28 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  27.03 
 
 		 353 aa  99.8  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3586  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1009  shufflon-specific DNA recombinase  48.15 
 
 		 111 aa  99.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173474  hitchhiker  0.000000000551255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  31.78 
 
 		 386 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  28.69 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0805  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  28.22 
 
 		 368 aa  96.7  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  29.48 
 
 		 386 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.41 
 
 		 380 aa  95.9  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  33.71 
 
 		 334 aa  95.9  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  28.21 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  28.14 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  28.21 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  32.21 
 
 		 381 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  24.92 
 
 		 365 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  24.85 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  28.5 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  32.97 
 
 		 204 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  28.8 
 
 		 364 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  30.04 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  27.78 
 
 		 341 aa  93.6  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  28.14 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  30.35 
 
 		 409 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2576  integrase family protein  29.45 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.478177  hitchhiker  0.000378812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2610  integrase family protein  29.45 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241311  unclonable  5.16639e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  25.08 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 402 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  30.32 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  27.59 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  27.31 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  23.96 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3233  phage integrase  23.44 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  32.38 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  32.38 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  28.81 
 
 		 275 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  32.38 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>