210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3178 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  100 
 
 		 339 aa  704    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  40.36 
 
 		 334 aa  255  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  42.86 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2234  integrase family protein  38.33 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  36.86 
 
 		 343 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2610  integrase family protein  32.75 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241311  unclonable  5.16639e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2576  integrase family protein  32.75 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.478177  hitchhiker  0.000378812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  33.24 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  32.84 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  31.64 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  33.55 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  33.99 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  33.43 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  30.18 
 
 		 340 aa  145  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  33.05 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  31.56 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  28.87 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  31.29 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  30.85 
 
 		 348 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  31.62 
 
 		 351 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  29.43 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  29.43 
 
 		 413 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  29.38 
 
 		 334 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  31.05 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  31.05 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  30.57 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  28.91 
 
 		 340 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  31.52 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  35.81 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  32.41 
 
 		 374 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  28.57 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  29 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  25.81 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  28.21 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  27.22 
 
 		 347 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  27.63 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  30.42 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  29.76 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  29.83 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  30.58 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  27.78 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.82 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  27.6 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  28.74 
 
 		 278 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  25 
 
 		 366 aa  85.9  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  27.17 
 
 		 531 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  28.69 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.18 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  28.69 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  25.83 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  25.38 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  32.09 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2435  integrase family protein  26.35 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.061585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  26.54 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  25.95 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  26.1 
 
 		 571 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  26.53 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.09 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  31.4 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1667  phage integrase family protein  29.75 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  32.81 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.34 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  25.86 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  22.19 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  28.81 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.42 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3233  phage integrase  22.8 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  28.34 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  24.21 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  27.02 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  22.13 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  26.55 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  22.13 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  20.06 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  23.34 
 
 		 429 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  25.34 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  25 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0773  phage integrase family protein  26.9 
 
 		 354 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0798  integrase family protein  26.9 
 
 		 354 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000196141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.79 
 
 		 404 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3586  phage integrase family protein  26.03 
 
 		 355 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.62 
 
 		 412 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0805  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 354 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  23.64 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  20.15 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  30 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  25.6 
 
 		 412 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  23.79 
 
 		 432 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.55 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  26.84 
 
 		 444 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.83 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  22.83 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  22.99 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  24.66 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>