117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1794 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  100 
 
 
343 aa  703    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2234  integrase family protein  59.48 
 
 
341 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  39.83 
 
 
334 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  36.86 
 
 
339 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2576  integrase family protein  39.04 
 
 
338 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.478177  hitchhiker  0.000378812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2610  integrase family protein  39.04 
 
 
338 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241311  unclonable  5.16639e-16 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  37.24 
 
 
286 aa  170  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  32.06 
 
 
365 aa  153  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  31.14 
 
 
327 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  31.23 
 
 
330 aa  142  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  33.1 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  33.57 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  33.21 
 
 
374 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  30.88 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  29.02 
 
 
328 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  33.45 
 
 
395 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  30.81 
 
 
347 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  30 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  30.69 
 
 
375 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  28.4 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  30.29 
 
 
332 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  30.62 
 
 
338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  29.82 
 
 
373 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  28.84 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  29.14 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  28.18 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  28.18 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  30.73 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  27.79 
 
 
340 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  29.45 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  28.85 
 
 
347 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  28.49 
 
 
351 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  28.49 
 
 
351 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  28.61 
 
 
339 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  27.57 
 
 
413 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  28.26 
 
 
339 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  26.91 
 
 
356 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  29.58 
 
 
352 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  30.33 
 
 
222 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  26.25 
 
 
366 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  25.78 
 
 
339 aa  86.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  27.27 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  26.58 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  36.76 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.14 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  25.07 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  26.91 
 
 
531 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  27.67 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  28.53 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1711  integrase family protein  25.08 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213299  hitchhiker  0.00000987295 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  23.77 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.17 
 
 
380 aa  63.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  21.61 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  24.32 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  25.74 
 
 
405 aa  62.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  23.77 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  26.33 
 
 
351 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  23.01 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  25.28 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  25.28 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  24.53 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  25.44 
 
 
365 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  27.78 
 
 
278 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  24.09 
 
 
421 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  24.13 
 
 
321 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  25.46 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  25.48 
 
 
362 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  23.88 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  32.82 
 
 
146 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1622  phage integrase family protein  24.29 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  23.64 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  23.64 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  21.07 
 
 
387 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  23.69 
 
 
335 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  29.31 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  23.77 
 
 
398 aa  50.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  22.83 
 
 
429 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3233  phage integrase  23.31 
 
 
356 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  21.91 
 
 
335 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  23.94 
 
 
337 aa  49.3  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1909  integrase family protein  28.3 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838759  hitchhiker  0.00000212902 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  25.33 
 
 
369 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  25.33 
 
 
369 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  25.33 
 
 
369 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  25.33 
 
 
369 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  24.76 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1202  integrase family protein  24.16 
 
 
346 aa  47  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0798  integrase family protein  25.78 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000196141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  34.85 
 
 
408 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1667  phage integrase family protein  28.75 
 
 
372 aa  46.2  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3586  phage integrase family protein  25 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0773  phage integrase family protein  25.78 
 
 
354 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0805  phage integrase family protein  25 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  21.64 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  24.4 
 
 
251 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3130  integrase, putative  34.09 
 
 
147 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.986552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  20.2 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  22.75 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  28.99 
 
 
387 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.01 
 
 
359 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>