More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03811 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  100 
 
 		 327 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  59.01 
 
 		 321 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  60.59 
 
 		 204 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  35.09 
 
 		 334 aa  175  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  34.26 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  30.06 
 
 		 339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  29.59 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  29.32 
 
 		 330 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  26.84 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  30.72 
 
 		 339 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  28.92 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  28.7 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  29.61 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  33.57 
 
 		 374 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  31.41 
 
 		 374 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04481  hypothetical protein  61.11 
 
 		 93 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  30.37 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  32.85 
 
 		 374 aa  119  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  27.54 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  29 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  30.38 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  30.38 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  28.94 
 
 		 340 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  32.27 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  30.23 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.76 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  30.16 
 
 		 380 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  29.62 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  29.62 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  28.52 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  29.17 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  30.12 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  29.51 
 
 		 395 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  27.07 
 
 		 348 aa  96.3  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  33.9 
 
 		 356 aa  95.9  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  30.66 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  25.85 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.48 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2234  integrase family protein  27.25 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  32.26 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  29.11 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  25.82 
 
 		 373 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  26.44 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  31.28 
 
 		 366 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  23.85 
 
 		 368 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  23.38 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  25.22 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1711  integrase family protein  25.43 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213299  hitchhiker  0.00000987295 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  25.76 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  23.84 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  27.76 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  23.95 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  27.11 
 
 		 571 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  26.21 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  26.3 
 
 		 398 aa  79.3  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  26.81 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  26.81 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  24.65 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  26.54 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  23.55 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  27.27 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  34.33 
 
 		 531 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  26.39 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  22.19 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  26.18 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  28.31 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  25.58 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  28.77 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3233  phage integrase  24.18 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  27 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.68 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.12 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  25.61 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 417 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  26.46 
 
 		 386 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  26.64 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.5 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  29.25 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  24.84 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  29.6 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  26.16 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  24.86 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1622  phage integrase family protein  22.84 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  24.17 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0798  integrase family protein  23.25 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000196141 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.36 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0773  phage integrase family protein  23.25 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3586  phage integrase family protein  22.93 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  27.43 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.92 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  29.03 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.65 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  26.99 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2610  integrase family protein  26.43 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241311  unclonable  5.16639e-16 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  29.17 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>