More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0382 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  93.63 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  60.59 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04481  hypothetical protein  78.49 
 
 		 93 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  36.5 
 
 		 334 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  35.96 
 
 		 338 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  32.99 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  33.82 
 
 		 374 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  32.02 
 
 		 328 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  32.84 
 
 		 374 aa  95.9  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  33.17 
 
 		 380 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  33.33 
 
 		 374 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  31.68 
 
 		 327 aa  95.1  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  32.97 
 
 		 337 aa  94  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  30.37 
 
 		 354 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  31.13 
 
 		 413 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  31.46 
 
 		 356 aa  87.8  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  31.53 
 
 		 330 aa  87.8  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  31.49 
 
 		 323 aa  87.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  34.75 
 
 		 332 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  33.82 
 
 		 395 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  31.02 
 
 		 375 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  29.86 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  29.5 
 
 		 347 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  29.96 
 
 		 352 aa  82.4  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  29.15 
 
 		 334 aa  81.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  31.32 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  28.64 
 
 		 386 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  28.64 
 
 		 347 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  28.64 
 
 		 347 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  28.34 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  28 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  28.96 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.79 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  31.34 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  27.52 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  30 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  31.11 
 
 		 531 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  28.57 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  31.38 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  28.5 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  29.87 
 
 		 339 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.76 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  31.47 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  27.05 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  32.1 
 
 		 412 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  29.22 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 387 aa  68.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  28.3 
 
 		 398 aa  68.6  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  27.05 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.28 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  27.05 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  28 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  30.67 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  28.76 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  32.02 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  33.8 
 
 		 571 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  29.83 
 
 		 369 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  29.69 
 
 		 354 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  29.83 
 
 		 369 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  29.83 
 
 		 369 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  29.83 
 
 		 369 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  31.52 
 
 		 339 aa  65.5  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 387 aa  65.5  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  30.82 
 
 		 401 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  33.13 
 
 		 367 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  30.54 
 
 		 393 aa  65.5  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  29.69 
 
 		 354 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  26.47 
 
 		 334 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  31.46 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  30.06 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  31.54 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  26.82 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  29.41 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  26.87 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.41 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  29.03 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  27.17 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  29.13 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  27.81 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0773  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 354 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3586  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 355 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0798  integrase family protein  26.72 
 
 		 354 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000196141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  28.4 
 
 		 350 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  26.14 
 
 		 351 aa  61.6  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0805  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 354 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.72 
 
 		 378 aa  61.2  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  27.71 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  23.49 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  26.6 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  27.71 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  25.98 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  26.75 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  29.35 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  26.1 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  28.97 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  31.67 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  30 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>