202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7113 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  100 
 
 		 347 aa  716    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  33.33 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  32.28 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  34.63 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  31.81 
 
 		 327 aa  157  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  33.24 
 
 		 340 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  31.17 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  29.86 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  31.41 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  29.95 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  31.83 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  29.04 
 
 		 340 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  29.75 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  29.86 
 
 		 348 aa  136  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  31.14 
 
 		 337 aa  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  31.36 
 
 		 373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  29.11 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  28.65 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2610  integrase family protein  31.92 
 
 		 338 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241311  unclonable  5.16639e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2576  integrase family protein  31.92 
 
 		 338 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.478177  hitchhiker  0.000378812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  30.81 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  31.14 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  30.95 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  30.86 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  31.43 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  29.46 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  26.42 
 
 		 413 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  29.43 
 
 		 347 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 347 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  31.99 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2234  integrase family protein  30.73 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  31.34 
 
 		 374 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  31.1 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  30.13 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  28.65 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  32.03 
 
 		 374 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  30.68 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  28.1 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  28.05 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  26.76 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  28.82 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  29.31 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2435  integrase family protein  28.23 
 
 		 389 aa  93.2  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.061585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  28.57 
 
 		 380 aa  89.4  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  30.33 
 
 		 364 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.39 
 
 		 359 aa  85.9  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  28.61 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  25.91 
 
 		 531 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  26.21 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  26.54 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  24.91 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  25.45 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  35.16 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  26.57 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  26.57 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  23.43 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  23.43 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1711  integrase family protein  26 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213299  hitchhiker  0.00000987295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  27.88 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  23.15 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1622  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 361 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  22.64 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  26.2 
 
 		 571 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  29.46 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  22.32 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  28.85 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  30.6 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0783  integrase family protein  24.89 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.282397  normal  0.170816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  23.98 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  24.27 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  23.36 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  29.84 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  22.67 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  25.85 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  22.91 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  21.52 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  23.37 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  28.57 
 
 		 412 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 291 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  26.78 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3233  phage integrase  22.59 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  24.75 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  23.65 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  24.42 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  24.71 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  24.91 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  24.43 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  24.6 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.65 
 
 		 385 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  24.6 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.38 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  21.83 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1667  phage integrase family protein  29.03 
 
 		 372 aa  53.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1494  putative integrase-like protein  51.06 
 
 		 233 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145939  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4065  integrase family protein  28.1 
 
 		 394 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>