106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_04481 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_04481  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  191  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  79.57 
 
 
321 aa  161  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  78.49 
 
 
204 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  60.44 
 
 
327 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  41.57 
 
 
334 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  38.04 
 
 
338 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  41.54 
 
 
354 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  39.36 
 
 
374 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  39.36 
 
 
374 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  37.36 
 
 
337 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  37.36 
 
 
395 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  35.56 
 
 
347 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  36.56 
 
 
375 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  33.33 
 
 
328 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  35.56 
 
 
340 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  35.11 
 
 
374 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0773  phage integrase family protein  33.33 
 
 
354 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0798  integrase family protein  33.33 
 
 
354 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000196141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  33.01 
 
 
413 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  32.97 
 
 
366 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  32.58 
 
 
365 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3586  phage integrase family protein  32.1 
 
 
355 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  32.95 
 
 
330 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  30.77 
 
 
356 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  34.09 
 
 
327 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  33.93 
 
 
323 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0805  phage integrase family protein  32.1 
 
 
354 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  32.94 
 
 
368 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.94 
 
 
380 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  30.86 
 
 
355 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3233  phage integrase  32.1 
 
 
356 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  31.76 
 
 
362 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  35.8 
 
 
351 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  30.23 
 
 
222 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  29.59 
 
 
332 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  32.26 
 
 
380 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  33.96 
 
 
402 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  30.34 
 
 
531 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  32.1 
 
 
356 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  44.83 
 
 
331 aa  50.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  44.68 
 
 
351 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  44.83 
 
 
331 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  44.68 
 
 
351 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  30.53 
 
 
411 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1711  integrase family protein  28.24 
 
 
380 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213299  hitchhiker  0.00000987295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  33.72 
 
 
278 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  32.04 
 
 
347 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  32.04 
 
 
347 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  30 
 
 
365 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  43.55 
 
 
379 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  30 
 
 
365 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  32.98 
 
 
405 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  33.82 
 
 
380 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  38.6 
 
 
251 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1622  phage integrase family protein  33.72 
 
 
361 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  29.21 
 
 
337 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  39.53 
 
 
339 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  31.58 
 
 
397 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  27.16 
 
 
357 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  39.53 
 
 
339 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  37.5 
 
 
350 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  33.33 
 
 
334 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  28.57 
 
 
340 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  29.57 
 
 
352 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  30.93 
 
 
334 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  33.33 
 
 
365 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  29.67 
 
 
336 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  34.78 
 
 
323 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.67 
 
 
359 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  33.33 
 
 
353 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  39.71 
 
 
369 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  33.33 
 
 
364 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  30.21 
 
 
379 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  32.97 
 
 
341 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  38.1 
 
 
435 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  35.09 
 
 
353 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  29.09 
 
 
348 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1727  phage integrase  29.85 
 
 
267 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  31.87 
 
 
341 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  38.24 
 
 
369 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  29.03 
 
 
373 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  33.33 
 
 
374 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1667  phage integrase family protein  38.46 
 
 
372 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  32.81 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30.85 
 
 
397 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  30.43 
 
 
336 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  27.68 
 
 
325 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  30.77 
 
 
357 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  31.03 
 
 
347 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2435  integrase family protein  42.86 
 
 
389 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.061585  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  30.3 
 
 
354 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  30.3 
 
 
354 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0783  integrase family protein  36.49 
 
 
465 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.282397  normal  0.170816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.42 
 
 
412 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  32.18 
 
 
381 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  39.62 
 
 
571 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  31.15 
 
 
387 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  38.89 
 
 
477 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  23.16 
 
 
429 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  43.48 
 
 
398 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>