38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3130 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I3130  integrase, putative  100 
 
 		 147 aa  304  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.986552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  44.86 
 
 		 340 aa  97.1  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  38.32 
 
 		 327 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  35.29 
 
 		 330 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  36.29 
 
 		 328 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  40.37 
 
 		 340 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  35 
 
 		 352 aa  84.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  41.75 
 
 		 334 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  40.2 
 
 		 339 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  37.25 
 
 		 337 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  35.19 
 
 		 338 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  34.31 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  42.53 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  31.48 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  35.29 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  34.26 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  36.27 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 347 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  31.82 
 
 		 347 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  30.91 
 
 		 351 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  30.91 
 
 		 351 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  30.36 
 
 		 353 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0416  phage integrase family site specific recombinase  39.08 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  33.33 
 
 		 413 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2234  integrase family protein  40 
 
 		 341 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  28.81 
 
 		 354 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  31.91 
 
 		 381 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  100 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  35.16 
 
 		 347 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  38.2 
 
 		 334 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  30.08 
 
 		 370 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  31.4 
 
 		 339 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  34.09 
 
 		 343 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  90.48 
 
 		 304 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  38.96 
 
 		 365 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  31.18 
 
 		 380 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  35.29 
 
 		 405 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  33.78 
 
 		 351 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>