84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2576 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2576  integrase family protein  100 
 
 		 338 aa  675    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.478177  hitchhiker  0.000378812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2610  integrase family protein  100 
 
 		 338 aa  675    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241311  unclonable  5.16639e-16 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2234  integrase family protein  42.69 
 
 		 341 aa  245  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  39.04 
 
 		 343 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  37.39 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  32.75 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  35.66 
 
 		 286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  31.92 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  31.7 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  29.14 
 
 		 327 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  30.57 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  32.18 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  31.7 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  27.79 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  28.37 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  28.8 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  28.45 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  29.6 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  29.69 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  31.73 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  30.26 
 
 		 373 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  28.23 
 
 		 380 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  29.23 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  26.45 
 
 		 413 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  28.45 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  29.13 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  28.45 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  30 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  29.33 
 
 		 354 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  27.2 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  29.72 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  27.08 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  31.09 
 
 		 222 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  29.18 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  31.56 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  28.62 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  27.21 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  28.98 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  28.98 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  29.44 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  28.51 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  27.69 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  28.2 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  27.78 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  33.33 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  22.67 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  24.71 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  25.67 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  24.68 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  25.17 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  25.97 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  26.72 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  29.24 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  24.6 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  24.16 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  25.45 
 
 		 531 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  23.33 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  29.88 
 
 		 391 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  23.33 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  29.01 
 
 		 204 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  23.03 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  28.44 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  25.96 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 379 aa  46.6  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  25.91 
 
 		 571 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  29.32 
 
 		 146 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.72 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.72 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  24.15 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  20.83 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  24.75 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.66 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0783  integrase family protein  25.32 
 
 		 465 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.282397  normal  0.170816 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  24.07 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2435  integrase family protein  26.28 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.061585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  24.56 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1667  phage integrase family protein  30.66 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  22.88 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3233  phage integrase  25.14 
 
 		 356 aa  43.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  38.18 
 
 		 356 aa  42.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0912  integrase family protein  21.74 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>