165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2030 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  100 
 
 		 365 aa  764    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1622  phage integrase family protein  45.71 
 
 		 361 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  42.39 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1711  integrase family protein  40.87 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213299  hitchhiker  0.00000987295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  38.96 
 
 		 368 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  38.31 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  35.75 
 
 		 351 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  35.29 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  37.01 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  31.91 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  31.9 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3233  phage integrase  34.47 
 
 		 356 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3586  phage integrase family protein  32.87 
 
 		 355 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  31.81 
 
 		 355 aa  172  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0798  integrase family protein  33.33 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000196141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0805  phage integrase family protein  33.91 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0773  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  32.29 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  30.96 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.27 
 
 		 380 aa  156  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  30.26 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  29.85 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  31.61 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  30.92 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  31.62 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  29.27 
 
 		 340 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  27.54 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  29.48 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  27.25 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  28.4 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  27.69 
 
 		 347 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  25.69 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  25.43 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  26.57 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  27.33 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  31.72 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  28.93 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  25.98 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  26.63 
 
 		 339 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32670  hypothetical protein  47.67 
 
 		 151 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  25 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  28.06 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  25.14 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  27.67 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  27.49 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  26.42 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  26.96 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  28.35 
 
 		 375 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  28.44 
 
 		 222 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  32.09 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  26.03 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  26.03 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.49 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  25.95 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  25.27 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  25.27 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  22.87 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  31.01 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  29.58 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  23.49 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  22.25 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  22.99 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  25.2 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  21.97 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  27.97 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  23.32 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1234  putative integrase/recombinase  36.56 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  0.825212 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  27.42 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  28.57 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1173  putative integrase/recombinase  36.56 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  23.31 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  27.22 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  27.22 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  27.22 
 
 		 451 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  25.44 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04481  hypothetical protein  32.58 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  24.53 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  26.63 
 
 		 456 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  23.45 
 
 		 571 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  24.13 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  21.84 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  21.14 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  23.98 
 
 		 251 aa  53.1  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  25.93 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  25.9 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  24.58 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  22.64 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25.53 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  24.62 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  20.5 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  28.86 
 
 		 159 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  21.77 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  21.77 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  23.95 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  23.12 
 
 		 384 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  23.12 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>