55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1009 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1009  shufflon-specific DNA recombinase  100 
 
 		 111 aa  226  9e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173474  hitchhiker  0.000000000551255 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  48.15 
 
 		 337 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  55.68 
 
 		 374 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  54.95 
 
 		 395 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  55.68 
 
 		 374 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  52.81 
 
 		 380 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  53.93 
 
 		 374 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  50 
 
 		 347 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  50 
 
 		 347 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  48.39 
 
 		 375 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  50 
 
 		 351 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  45.56 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  50 
 
 		 351 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  48.39 
 
 		 413 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  44.95 
 
 		 348 aa  80.1  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  43.82 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  41.58 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  49.45 
 
 		 330 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  39.45 
 
 		 352 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  40.71 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  47.56 
 
 		 327 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  39.68 
 
 		 323 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  44.21 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  37.5 
 
 		 381 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  40.91 
 
 		 353 aa  60.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  43.53 
 
 		 328 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  36.21 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  38.2 
 
 		 356 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  37.62 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  34.83 
 
 		 338 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  41.3 
 
 		 339 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  35.87 
 
 		 251 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  35.23 
 
 		 339 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  27.97 
 
 		 334 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  38.1 
 
 		 340 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  36.08 
 
 		 334 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  39.18 
 
 		 399 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  35.42 
 
 		 347 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  35.23 
 
 		 339 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  29.03 
 
 		 397 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  36.89 
 
 		 354 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  36.89 
 
 		 354 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  31.82 
 
 		 363 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  33.7 
 
 		 359 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  35.42 
 
 		 343 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  45.28 
 
 		 571 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  40.35 
 
 		 332 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  34 
 
 		 348 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  31.09 
 
 		 400 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  31.09 
 
 		 400 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  52.08 
 
 		 380 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  31.48 
 
 		 308 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 379 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  31.48 
 
 		 308 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  32.95 
 
 		 386 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>