More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0930 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0930  site-specific recombinase, phage integrase family protein  100 
 
 
385 aa  780    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  33.85 
 
 
377 aa  178  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  27.62 
 
 
407 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  26.72 
 
 
372 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  28.51 
 
 
368 aa  94.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  23.68 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  25.14 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.48 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  21.87 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  23.7 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  24.11 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  32.8 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  29.17 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  26.78 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.59 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.09 
 
 
482 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  27.46 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  27.46 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  25.89 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  23.29 
 
 
400 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.07 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  25.56 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  22.19 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  25.29 
 
 
338 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  24.81 
 
 
350 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  24.81 
 
 
314 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  24.81 
 
 
343 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  26.09 
 
 
401 aa  62.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  30.19 
 
 
159 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.33 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.54 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  24.9 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  24.59 
 
 
429 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.54 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  22.55 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  23.83 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  23.28 
 
 
345 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  25.67 
 
 
332 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  28.24 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  23.83 
 
 
352 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  21.99 
 
 
294 aa  60.1  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  25.85 
 
 
338 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  32.3 
 
 
172 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  23.96 
 
 
334 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  30.46 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  24.81 
 
 
332 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  51.92 
 
 
99 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  20.67 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  27.64 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  27.32 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  22.3 
 
 
304 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  22.58 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  26.61 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  31.14 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  23.79 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  24.2 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  23.95 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  23.95 
 
 
341 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  26.77 
 
 
324 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  27.78 
 
 
258 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  25.43 
 
 
336 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  25.86 
 
 
335 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.38 
 
 
392 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  22.7 
 
 
401 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  25.88 
 
 
313 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  22.96 
 
 
339 aa  57  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  22.95 
 
 
304 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  26.8 
 
 
333 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  25.65 
 
 
296 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  23.63 
 
 
298 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  23.63 
 
 
298 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  23.95 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  26.7 
 
 
347 aa  56.2  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  25.59 
 
 
335 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  22.3 
 
 
304 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  20.95 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  20.67 
 
 
363 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  52.17 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  24.39 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  36.14 
 
 
121 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  25.1 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  25.69 
 
 
451 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63440  bacteriophage integrase  50 
 
 
126 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  25.85 
 
 
323 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.65 
 
 
315 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  27.27 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  23.81 
 
 
397 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  27.59 
 
 
394 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  47.73 
 
 
274 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  24.05 
 
 
336 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  24.79 
 
 
334 aa  53.1  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  24.45 
 
 
476 aa  53.1  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  30.46 
 
 
324 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3056  integrase family protein  47.73 
 
 
164 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0372474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  47.73 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.08 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.41 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  28.72 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  22.75 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  23.63 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>