63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4174 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  100 
 
 		 480 aa  980    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  51.59 
 
 		 471 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4097  integrase family protein  48.49 
 
 		 464 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2395  integrase family protein  45.16 
 
 		 456 aa  346  4e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  32.1 
 
 		 470 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  27.97 
 
 		 450 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  23.92 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  32.78 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  27.2 
 
 		 581 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  29.81 
 
 		 568 aa  73.6  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  27.48 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1223  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  31.64 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  24.48 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  33.96 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  25.98 
 
 		 651 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  27.31 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  29.43 
 
 		 567 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  25.19 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  25.08 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  29.58 
 
 		 602 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  24.6 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  25.18 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  27.91 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  26.36 
 
 		 550 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  27.09 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  29.76 
 
 		 391 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  25.99 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  28.89 
 
 		 388 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  27.89 
 
 		 565 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  26.05 
 
 		 538 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  28.66 
 
 		 538 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  25.59 
 
 		 563 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  25 
 
 		 439 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  25 
 
 		 412 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  24.85 
 
 		 431 aa  47.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  28.05 
 
 		 687 aa  47.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  30.11 
 
 		 588 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.41 
 
 		 433 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  27.61 
 
 		 649 aa  47  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1202  integrase family protein  24.85 
 
 		 346 aa  47  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  27.61 
 
 		 556 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  23.92 
 
 		 587 aa  47  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  28.1 
 
 		 533 aa  46.6  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  22.39 
 
 		 283 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  27.52 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  30.63 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  32.26 
 
 		 593 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  29.05 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  27.01 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  26.26 
 
 		 602 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  22.48 
 
 		 283 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  24.72 
 
 		 336 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  25.69 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  24.2 
 
 		 566 aa  44.3  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  25.41 
 
 		 386 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  26.35 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  22.49 
 
 		 477 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  25.16 
 
 		 438 aa  43.9  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  23.69 
 
 		 605 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  23.94 
 
 		 527 aa  43.5  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>