111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7504 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  100 
 
 		 538 aa  1092    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  38.44 
 
 		 509 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  35.73 
 
 		 529 aa  229  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  34.42 
 
 		 529 aa  225  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  31.28 
 
 		 515 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  32.37 
 
 		 563 aa  198  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  38.31 
 
 		 424 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  36.5 
 
 		 599 aa  193  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  30.42 
 
 		 567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  37.38 
 
 		 310 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  32.03 
 
 		 558 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  37.85 
 
 		 441 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  28.83 
 
 		 584 aa  173  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  29.35 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  33.71 
 
 		 566 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  27.07 
 
 		 566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  28.79 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  28.79 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  25.56 
 
 		 439 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  31.87 
 
 		 564 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  22.49 
 
 		 687 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  25.16 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  25.43 
 
 		 441 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  27.61 
 
 		 646 aa  70.9  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  25.7 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  23.41 
 
 		 527 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  25.9 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  45.07 
 
 		 563 aa  70.1  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  21.43 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  32.12 
 
 		 602 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  26.56 
 
 		 529 aa  68.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  29.33 
 
 		 605 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  25.09 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  27.65 
 
 		 509 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  23.85 
 
 		 564 aa  67  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  32.24 
 
 		 559 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  24.61 
 
 		 538 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  24.9 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  23.51 
 
 		 635 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  25.49 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  31.69 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  28.05 
 
 		 581 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  28.35 
 
 		 588 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  27.94 
 
 		 618 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  27.66 
 
 		 587 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  27.03 
 
 		 588 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  27 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  23.89 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  26.46 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  23.64 
 
 		 430 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  26.91 
 
 		 602 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  33.8 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  33.8 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  33.8 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  22.91 
 
 		 472 aa  56.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  26.06 
 
 		 589 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  29.19 
 
 		 616 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  23.56 
 
 		 358 aa  54.3  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  24.04 
 
 		 284 aa  53.9  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  25.84 
 
 		 285 aa  53.5  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  23.87 
 
 		 283 aa  53.9  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.71 
 
 		 392 aa  53.5  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  25.65 
 
 		 411 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  23.47 
 
 		 304 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  31.17 
 
 		 565 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  27.11 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  21.35 
 
 		 651 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 499 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  25.95 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  23.08 
 
 		 455 aa  51.6  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  25.94 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  25.94 
 
 		 446 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  25.94 
 
 		 446 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  26.67 
 
 		 431 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  26.05 
 
 		 480 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  33.8 
 
 		 602 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  25.1 
 
 		 662 aa  50.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  25.08 
 
 		 288 aa  50.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  26.34 
 
 		 657 aa  50.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  26.46 
 
 		 398 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  23.66 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  27.81 
 
 		 619 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  26.96 
 
 		 348 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  24.2 
 
 		 593 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  25 
 
 		 428 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  21.2 
 
 		 305 aa  48.5  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0436  hypothetical protein  31.25 
 
 		 99 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  23.81 
 
 		 649 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  28.93 
 
 		 479 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  23.55 
 
 		 351 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  22.38 
 
 		 535 aa  47.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  23.75 
 
 		 351 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  23.47 
 
 		 286 aa  47.4  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  27.94 
 
 		 412 aa  47.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  25.55 
 
 		 508 aa  47  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  25.55 
 
 		 508 aa  47  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  25.42 
 
 		 317 aa  47  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  23.68 
 
 		 692 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 720 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  25.83 
 
 		 651 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>