221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1028 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5552  integrase family protein  93.87 
 
 		 424 aa  813    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1028  Phage integrase  100 
 
 		 424 aa  874    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214982  normal  0.0128497 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3239  integrase family protein  67.92 
 
 		 424 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0978515  normal  0.26506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1914  integrative genetic element Gsu32, integrase, putative  57.93 
 
 		 433 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409637  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  54.92 
 
 		 425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4138  integrase family protein  39.21 
 
 		 403 aa  259  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.551003  hitchhiker  0.000000726175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  27.72 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  27.95 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  24.66 
 
 		 439 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  26.44 
 
 		 414 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  26.44 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  30.23 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  27.95 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  25.5 
 
 		 427 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.63 
 
 		 413 aa  93.2  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  30.47 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  30.94 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  27.21 
 
 		 439 aa  86.7  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  27.85 
 
 		 410 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  24.89 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.01 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  26.37 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  26.37 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  24.43 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  30.45 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  26.06 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  23.63 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  27.55 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  33.49 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.17 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  26.92 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  27.15 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  31.88 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  25.69 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  32.28 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  24.43 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  25.5 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  25.06 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  25.26 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  24.93 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  24.53 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  24.31 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  24.55 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  23.82 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  22.49 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  24.27 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  27.57 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  27.1 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  30.73 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  24.87 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  24.8 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  24.44 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0948  putative integrase  24.46 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  23.86 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  25.19 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  30.77 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  23 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  24.55 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  26.2 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  28.91 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  28.06 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  29.33 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4176  hypothetical protein  46.27 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  27.59 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  27.96 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  25.8 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  23.95 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  29.76 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  28.3 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  23.1 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1277  putative phage integrase  25.3 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  23.18 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  25.57 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  23.47 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  25.3 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  24.78 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  23.49 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  25.19 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  30.1 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  29.5 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  31.79 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  24.53 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  27.61 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  23.63 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1410  Phage integrase  21.65 
 
 		 396 aa  57  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  21.45 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  26.1 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  25.18 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  25.65 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.14 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  24.75 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  24.3 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>