249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4176 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4176  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  331  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  63.56 
 
 		 419 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  48.78 
 
 		 419 aa  120  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  47.97 
 
 		 439 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  48 
 
 		 420 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  47.15 
 
 		 420 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  48.78 
 
 		 422 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  46.34 
 
 		 422 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  45.76 
 
 		 418 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  42.11 
 
 		 403 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  41.41 
 
 		 425 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  42.19 
 
 		 432 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  39.84 
 
 		 404 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  40.94 
 
 		 405 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  38.24 
 
 		 404 aa  87.8  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  39.32 
 
 		 410 aa  84.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  36.8 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  38.76 
 
 		 515 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.56 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  39.2 
 
 		 427 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  37.6 
 
 		 413 aa  75.1  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  36.21 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  35.96 
 
 		 409 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  35.96 
 
 		 409 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  35.04 
 
 		 414 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  38.02 
 
 		 403 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  36.52 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  36.75 
 
 		 455 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  34.45 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  46.58 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  29.45 
 
 		 439 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  32.03 
 
 		 449 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  35.09 
 
 		 418 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2105  integrase  34.51 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  35.85 
 
 		 361 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5552  integrase family protein  44.93 
 
 		 424 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  33.68 
 
 		 427 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  33.33 
 
 		 412 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  46.15 
 
 		 429 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  33.33 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1028  Phage integrase  46.27 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214982  normal  0.0128497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  33.33 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  44 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  41.79 
 
 		 425 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  33.91 
 
 		 418 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  42.86 
 
 		 427 aa  62  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  41.43 
 
 		 413 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  41.18 
 
 		 437 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  32.46 
 
 		 418 aa  61.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  36 
 
 		 400 aa  60.8  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  33.6 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  31.58 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  31.58 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  37.5 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  40.32 
 
 		 453 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  38.36 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  43.28 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  30.91 
 
 		 409 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  28.21 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3239  integrase family protein  41.79 
 
 		 424 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0978515  normal  0.26506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1318  phage integrase  30.16 
 
 		 457 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  41.57 
 
 		 428 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  30.65 
 
 		 409 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  33.61 
 
 		 414 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  31.9 
 
 		 418 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  41.79 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  36.36 
 
 		 400 aa  58.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  27.35 
 
 		 401 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  33.94 
 
 		 418 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  41.54 
 
 		 439 aa  57.8  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  35.04 
 
 		 426 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  34.43 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1410  Phage integrase  29.27 
 
 		 396 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  38.67 
 
 		 414 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  32.23 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  39.5 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  32.11 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  29.27 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  33.05 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  38.57 
 
 		 423 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  34.19 
 
 		 446 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  32.35 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  32.5 
 
 		 403 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  31.5 
 
 		 413 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  43.28 
 
 		 434 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  34.4 
 
 		 421 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  32.79 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 426 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  31.15 
 
 		 413 aa  55.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  40 
 
 		 450 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  41.79 
 
 		 389 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  31.2 
 
 		 403 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1914  integrative genetic element Gsu32, integrase, putative  35.71 
 
 		 433 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409637  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  29.84 
 
 		 394 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 403 aa  54.3  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  33.68 
 
 		 453 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  31.58 
 
 		 418 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  31.45 
 
 		 415 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  29.84 
 
 		 418 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3699  phage integrase  29.92 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>