194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1914 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1914  integrative genetic element Gsu32, integrase, putative  100 
 
 
433 aa  888    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409637  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3239  integrase family protein  59.38 
 
 
424 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0978515  normal  0.26506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1028  Phage integrase  57.93 
 
 
424 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214982  normal  0.0128497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5552  integrase family protein  57.93 
 
 
424 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  56.25 
 
 
425 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4138  integrase family protein  39.75 
 
 
403 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.551003  hitchhiker  0.000000726175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  25.67 
 
 
433 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  30.81 
 
 
437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  25.18 
 
 
439 aa  97.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  33.16 
 
 
453 aa  97.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  23.66 
 
 
449 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  25.25 
 
 
439 aa  93.2  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  24.26 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  24.62 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  24.75 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  31.94 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  26.35 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  24.51 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  22.13 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  26.43 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  25.44 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  27.41 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  24.62 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  25.69 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  27.65 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  31.16 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  24.6 
 
 
403 aa  77  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  22.13 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.79 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  22.61 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  22.88 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  23.14 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  31.43 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  29.04 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  36.84 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  23.87 
 
 
481 aa  73.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  28.35 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  32.2 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  24.88 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  25.66 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  26.52 
 
 
515 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  24.94 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  26.15 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  24.87 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  26.23 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  24.54 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  23.85 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  26.63 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  24.55 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  24.58 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  25.7 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  25.23 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  25.23 
 
 
414 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  24.31 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  23.29 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  25.23 
 
 
409 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  24.47 
 
 
400 aa  64.3  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  23.16 
 
 
410 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  24.05 
 
 
413 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  27.93 
 
 
389 aa  63.2  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  28.51 
 
 
434 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  21.85 
 
 
409 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  22.4 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1861  phage integrase family protein  25.44 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00488759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4046  hypothetical protein  30.6 
 
 
189 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3254  phage integrase family protein  25.81 
 
 
422 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  25.4 
 
 
423 aa  62.4  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  25.84 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  25.54 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  28.77 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  26.08 
 
 
427 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3487  integrase family protein  25.81 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0968357  unclonable  0.00000880604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1978  integrase family protein  25.44 
 
 
422 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000635719  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2555  phage integrase family protein  25.44 
 
 
422 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3363  phage integrase family protein  25.81 
 
 
422 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.267116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  25.12 
 
 
429 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  25.98 
 
 
419 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1973  phage integrase family protein  25.56 
 
 
422 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.73 
 
 
415 aa  59.7  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2028  integrase family protein  25.19 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0404622  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  26.92 
 
 
420 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  23.56 
 
 
429 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3391  integrase family protein  25.19 
 
 
422 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443618 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0948  putative integrase  23.66 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  26.92 
 
 
402 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  28.96 
 
 
403 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.74 
 
 
414 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  25.38 
 
 
411 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  23.39 
 
 
400 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00841  integrase  25.75 
 
 
356 aa  57.4  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  25.56 
 
 
398 aa  57.4  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  21.33 
 
 
389 aa  57  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  23 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3306  phage integrase family protein  30.58 
 
 
460 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  21.16 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  23.91 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  23.33 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  23.38 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  26.04 
 
 
445 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  25.19 
 
 
443 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>