192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1318 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1318  phage integrase  100 
 
 		 457 aa  929    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5206  phage integrase  35.73 
 
 		 451 aa  203  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0368  phage integrase  33.11 
 
 		 469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00841  integrase  28.99 
 
 		 356 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1061  phage integrase family protein  29.29 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.69421  normal  0.669577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0672  phage integrase  23.63 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7388  putative integrase  27.53 
 
 		 432 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3051  integrase family protein  28.09 
 
 		 413 aa  91.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0515706  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 453 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0792  integrase family protein  28.79 
 
 		 417 aa  90.5  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.637485 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  25.06 
 
 		 439 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  24.75 
 
 		 418 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  28.96 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  24.1 
 
 		 420 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  24.23 
 
 		 418 aa  86.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  26.48 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  24.83 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  25.78 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3795  integrase family protein  30.68 
 
 		 413 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000111159  unclonable  0.000000215958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  24.75 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  23.44 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  33.16 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  23.62 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  24.76 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  21.78 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  25.45 
 
 		 403 aa  79.7  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  24.57 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  24.03 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  23.33 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  24.03 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  24.5 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  24.34 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  23.41 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  26.73 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  24.71 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  27.39 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  25.87 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  23.63 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  25.12 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  23.83 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  24.21 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  23.33 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  29.33 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  23.27 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  22.88 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  24.22 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  25.36 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  23.7 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  25.87 
 
 		 409 aa  67  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  25 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  23.4 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 394 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  24.04 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  23.54 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3107  integrase  30.58 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0236409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  23.92 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  24.15 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  22.33 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  25.23 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  24.75 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  23.35 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  24.46 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  25.12 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  24.77 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  23.68 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  21.73 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  24.57 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  25 
 
 		 643 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  22.25 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  28.69 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  22.72 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  22.52 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  24.31 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  24.83 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  24.84 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  28.07 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  23.11 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  22.64 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  24.83 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  23.15 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  24.05 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  22.97 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  24.77 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4176  hypothetical protein  30.16 
 
 		 161 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  22.58 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  24.25 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  24.69 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  21.79 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  26.22 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  23.9 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1813  integrase family protein  25.61 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.471749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  24.28 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  22.95 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  24.76 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  29.58 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  23.42 
 
 		 428 aa  57  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  20.72 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>