More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1813 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1813  integrase family protein  100 
 
 		 285 aa  587  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.471749 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  83.63 
 
 		 414 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  46.74 
 
 		 389 aa  236  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  41.2 
 
 		 391 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  40.88 
 
 		 394 aa  202  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  42.05 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  40.88 
 
 		 396 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  37.94 
 
 		 404 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  37.13 
 
 		 390 aa  191  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  40.91 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.11 
 
 		 394 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.11 
 
 		 394 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.75 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  40.84 
 
 		 397 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  38.69 
 
 		 404 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  38.66 
 
 		 438 aa  188  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  40.67 
 
 		 404 aa  189  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  40.67 
 
 		 396 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  38.95 
 
 		 402 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  38.32 
 
 		 404 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  38.32 
 
 		 404 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  40.15 
 
 		 410 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  37.41 
 
 		 395 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  40.08 
 
 		 389 aa  185  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  40.3 
 
 		 404 aa  185  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  37.96 
 
 		 404 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  40.3 
 
 		 404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  39.7 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  37.64 
 
 		 404 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  37.64 
 
 		 404 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  37.96 
 
 		 404 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  39.39 
 
 		 387 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  37.64 
 
 		 404 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  39.05 
 
 		 401 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  37.68 
 
 		 421 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  40.15 
 
 		 396 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  38.55 
 
 		 404 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  37.31 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  38.29 
 
 		 394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  38.29 
 
 		 394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  38.63 
 
 		 407 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  39.7 
 
 		 401 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  39.33 
 
 		 395 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  38.04 
 
 		 397 aa  178  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  38.2 
 
 		 417 aa  178  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  37.64 
 
 		 404 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  37.13 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  39.05 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  38.64 
 
 		 391 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  40.37 
 
 		 402 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  38.77 
 
 		 400 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  37.91 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  36.59 
 
 		 425 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  38.87 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  38.69 
 
 		 410 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  40.3 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  37.82 
 
 		 404 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  36.13 
 
 		 402 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  37.45 
 
 		 395 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  36.04 
 
 		 428 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  36.04 
 
 		 425 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  38.55 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  37.13 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  35.82 
 
 		 422 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  38.35 
 
 		 402 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  37.36 
 
 		 406 aa  168  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  35.34 
 
 		 425 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  39.49 
 
 		 428 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  38.91 
 
 		 378 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  37.59 
 
 		 409 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  37.5 
 
 		 413 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  33.95 
 
 		 440 aa  165  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0927  integrase family protein  35.82 
 
 		 422 aa  165  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  37.79 
 
 		 405 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  36.23 
 
 		 407 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  36.7 
 
 		 393 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  36 
 
 		 445 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  36.65 
 
 		 403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  36.92 
 
 		 412 aa  162  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  34.89 
 
 		 419 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  34.89 
 
 		 419 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  35.71 
 
 		 401 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  36.36 
 
 		 404 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  35.02 
 
 		 418 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  35.09 
 
 		 409 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  35.34 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  38.91 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  37.12 
 
 		 403 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  35.11 
 
 		 421 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  34.72 
 
 		 414 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  36.23 
 
 		 417 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  33.94 
 
 		 410 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  34.72 
 
 		 409 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  35.53 
 
 		 404 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2305  integrase  34.04 
 
 		 424 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000673705  hitchhiker  1.06104e-16 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  36.17 
 
 		 429 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  35.79 
 
 		 421 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  32.71 
 
 		 394 aa  156  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.89 
 
 		 420 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2191  Phage integrase  34.42 
 
 		 418 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>