More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1340 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  79.66 
 
 		 644 aa  767    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1213  phage integrase family protein  80.16 
 
 		 411 aa  641    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550435  normal  0.724829 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  100 
 
 		 487 aa  994    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  94.85 
 
 		 643 aa  911    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1597  integrase family protein  70.99 
 
 		 602 aa  624  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.754785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  68.58 
 
 		 618 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2408  integrase (int)  64.72 
 
 		 617 aa  592  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.71715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1977  phage integrase family protein  64.72 
 
 		 617 aa  591  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  61.96 
 
 		 601 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4139  integrase family protein  58.7 
 
 		 642 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217214  hitchhiker  0.0000125149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2403  phage integrase  84.23 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000050364  decreased coverage  0.00000383819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2408  phage-related integrase  70.94 
 
 		 206 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00105004  decreased coverage  0.00000355943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  39.26 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  39.95 
 
 		 401 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  38.33 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  38.71 
 
 		 396 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  37.35 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  37.74 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  37.83 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  37.93 
 
 		 391 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  37.98 
 
 		 402 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  37.59 
 
 		 404 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  37.29 
 
 		 404 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  37.56 
 
 		 402 aa  263  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  40.33 
 
 		 402 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  38.77 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  37.59 
 
 		 391 aa  260  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  36.56 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  36.6 
 
 		 396 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.73 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  38.57 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.98 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  38.52 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.98 
 
 		 394 aa  251  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  36.43 
 
 		 410 aa  250  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  36.39 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  36.45 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  36.45 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  36.96 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  36.71 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  36.71 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  36.45 
 
 		 417 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  38.76 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  34.94 
 
 		 404 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  36.34 
 
 		 404 aa  236  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  35.42 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  35.18 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  35.18 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  34.47 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  34.99 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  34.7 
 
 		 404 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  36.45 
 
 		 407 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  35.19 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  35.24 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  34.52 
 
 		 424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  33.49 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  34.52 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  34.2 
 
 		 404 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  34.31 
 
 		 404 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  36.39 
 
 		 421 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0927  integrase family protein  34.52 
 
 		 422 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  34.76 
 
 		 419 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  33.25 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  33.73 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  34.61 
 
 		 421 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  33.49 
 
 		 418 aa  207  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  34.39 
 
 		 438 aa  207  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  33.18 
 
 		 414 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  33.49 
 
 		 419 aa  207  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  32.78 
 
 		 425 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  34.21 
 
 		 419 aa  206  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  35.81 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  34.04 
 
 		 425 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  35.01 
 
 		 406 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  35 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  33.25 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  34.13 
 
 		 394 aa  203  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  34.51 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  34.8 
 
 		 401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0444  phage integrase  35.51 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  33.74 
 
 		 421 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  33.17 
 
 		 404 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  35.49 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  36.32 
 
 		 402 aa  196  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  33.17 
 
 		 421 aa  196  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2191  Phage integrase  33.33 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  32.78 
 
 		 412 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  32.53 
 
 		 419 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  32.52 
 
 		 399 aa  194  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.25 
 
 		 420 aa  194  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 420 aa  194  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  31.54 
 
 		 397 aa  194  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  33.74 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  32.27 
 
 		 403 aa  193  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  31.34 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  35.48 
 
 		 462 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  33.41 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  32.76 
 
 		 402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.93 
 
 		 422 aa  190  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  33.02 
 
 		 409 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>