112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4138 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4138  integrase family protein  100 
 
 		 403 aa  816    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.551003  hitchhiker  0.000000726175 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1914  integrative genetic element Gsu32, integrase, putative  39.75 
 
 		 433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409637  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  40.2 
 
 		 425 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1028  Phage integrase  39.21 
 
 		 424 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214982  normal  0.0128497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5552  integrase family protein  39.21 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3239  integrase family protein  39.04 
 
 		 424 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0978515  normal  0.26506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  24.65 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  23.28 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  25.64 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.97 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  33.12 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  24.94 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  24.88 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  32.57 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  25.8 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  23.47 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  25.07 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  29.38 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  26.61 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  23.42 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  28.11 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  25.13 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  26.33 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  26.29 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  22.77 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  22.64 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  25 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  23.06 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  24.55 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.65 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  23.99 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  22.54 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  23.56 
 
 		 481 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  25.26 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  27.14 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  25.13 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2408  integrase (int)  25.06 
 
 		 617 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.71715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  22.55 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  27.57 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2408  phage-related integrase  29.3 
 
 		 206 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00105004  decreased coverage  0.00000355943 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1977  phage integrase family protein  25.06 
 
 		 617 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  23.6 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  23.68 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1597  integrase family protein  24.41 
 
 		 602 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.754785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  27.05 
 
 		 618 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  26.41 
 
 		 403 aa  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.82 
 
 		 394 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  25.82 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  23.51 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  23.34 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  24.03 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1318  phage integrase  25 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.49 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  25.81 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  25.83 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  22.22 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  22.55 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  20.75 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1213  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550435  normal  0.724829 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  24.39 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  23.27 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  22.22 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  27.91 
 
 		 434 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  27.87 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  21.94 
 
 		 361 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1555  phage integrase, putative  27.27 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.206278  decreased coverage  0.0000047649 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  21.75 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  22.74 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  22.45 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3377  phage integrase family protein  26.51 
 
 		 353 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  27.21 
 
 		 407 aa  47  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  25.96 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  24.12 
 
 		 644 aa  46.6  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  22.28 
 
 		 409 aa  46.6  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  25.56 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  21.39 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  22.28 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  22.53 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  25.17 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  24.56 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  24.03 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  24.38 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  25.75 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  25.65 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  22.25 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  22.34 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  25.1 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  23.6 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  23.86 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  23.2 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>