More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0948 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0948  putative integrase  100 
 
 		 385 aa  801    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  34.2 
 
 		 401 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  33.94 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  32.46 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  30.18 
 
 		 393 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  28.84 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  31.19 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  30.41 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  29.77 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  30.38 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  28.98 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  27.93 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  26.93 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  26.43 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  28.35 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  28.65 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  26.15 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  28.97 
 
 		 419 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  26.26 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  27.17 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  26.67 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  25.49 
 
 		 429 aa  112  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  26.85 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  27.89 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.84 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  25.07 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  29 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  27.05 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  24.35 
 
 		 391 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  26.95 
 
 		 404 aa  99.8  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  24.6 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  25.19 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  26.3 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  25.53 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  22.34 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  23.26 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  23.26 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  24.38 
 
 		 406 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  23.9 
 
 		 396 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  23.86 
 
 		 421 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.1 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  23.94 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.54 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  24.11 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  26.38 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  24.62 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.6 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  22.77 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02760  hypothetical protein  26.49 
 
 		 319 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000757589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  23.54 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.83 
 
 		 334 aa  93.6  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  25.26 
 
 		 409 aa  93.2  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.35 
 
 		 421 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  24.37 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  25.56 
 
 		 421 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  22.39 
 
 		 396 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2383  integrase family protein  25.35 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  25.14 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  25 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  24.1 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  24.2 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  22.92 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  24.61 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  24.42 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  24.3 
 
 		 418 aa  90.5  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  26.08 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  24.13 
 
 		 415 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  25.38 
 
 		 275 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  25.84 
 
 		 420 aa  90.1  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  24.07 
 
 		 643 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  23.26 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  24.03 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  25.07 
 
 		 405 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  23.82 
 
 		 487 aa  89.7  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  24.28 
 
 		 402 aa  89.4  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  23.54 
 
 		 401 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  24.14 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.48 
 
 		 420 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  24.32 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  26.65 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  24.32 
 
 		 409 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  23.88 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  24.93 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  25.07 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  22.74 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  24.14 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  26.2 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  25.52 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  25.07 
 
 		 515 aa  87  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  23.38 
 
 		 601 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  25 
 
 		 367 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  24.46 
 
 		 396 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  23.74 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  26.17 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>