115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0243 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  100 
 
 		 509 aa  1037    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  45.23 
 
 		 424 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  32.83 
 
 		 515 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  38.44 
 
 		 538 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  33.94 
 
 		 529 aa  236  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  36.63 
 
 		 599 aa  236  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  31.08 
 
 		 584 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  32.19 
 
 		 558 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  32.62 
 
 		 529 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  34.86 
 
 		 563 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  36.2 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  30.85 
 
 		 567 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  36.57 
 
 		 310 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  27.34 
 
 		 566 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  26.54 
 
 		 566 aa  124  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  32.99 
 
 		 560 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  30.45 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  28.46 
 
 		 687 aa  93.2  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  31.23 
 
 		 605 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  24.35 
 
 		 559 aa  90.5  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  25.35 
 
 		 581 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  25.83 
 
 		 533 aa  86.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  35.94 
 
 		 602 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  35.19 
 
 		 563 aa  84  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  27.99 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  31.68 
 
 		 564 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  25.5 
 
 		 550 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  31.28 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  25.86 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  26.72 
 
 		 587 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  30.12 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  27.71 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  25.38 
 
 		 529 aa  72  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  29.44 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  28.45 
 
 		 602 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  26.5 
 
 		 602 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  23.01 
 
 		 564 aa  70.1  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  23.59 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  28.06 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  31.72 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  25.77 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  24.91 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  27.27 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  22.92 
 
 		 588 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  25.77 
 
 		 452 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  33.33 
 
 		 619 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  27 
 
 		 692 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  22.54 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  26.27 
 
 		 635 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  26.67 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  21.17 
 
 		 568 aa  65.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  23.46 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  23.85 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  28.15 
 
 		 618 aa  64.7  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  25.21 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  26.19 
 
 		 646 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  25.81 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  27.87 
 
 		 649 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  28.04 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  34.13 
 
 		 565 aa  60.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  22.34 
 
 		 651 aa  60.5  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  26.57 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  28.37 
 
 		 616 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  27.75 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  25.71 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  22.88 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  28.87 
 
 		 582 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  26.26 
 
 		 588 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  30.07 
 
 		 589 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 593 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 720 aa  54.7  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  24.57 
 
 		 531 aa  54.7  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  30.07 
 
 		 482 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3682  hypothetical protein  29.71 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.77 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  32.08 
 
 		 687 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  25.07 
 
 		 527 aa  51.2  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  24.39 
 
 		 279 aa  50.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  29.55 
 
 		 651 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  22.3 
 
 		 458 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  25.27 
 
 		 351 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  24.18 
 
 		 548 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  26.34 
 
 		 352 aa  49.3  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  24.64 
 
 		 328 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  26.58 
 
 		 379 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  27.67 
 
 		 508 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  27.67 
 
 		 508 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.03 
 
 		 317 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  25.11 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  24.55 
 
 		 351 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  26.01 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  21.52 
 
 		 332 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  22 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  27.67 
 
 		 348 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  24.9 
 
 		 302 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  25.11 
 
 		 302 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 298 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  22.22 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>