89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2183 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  100 
 
 		 508 aa  1057    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  100 
 
 		 508 aa  1057    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  28.25 
 
 		 619 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  25.44 
 
 		 587 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3682  hypothetical protein  32.21 
 
 		 486 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  24.79 
 
 		 556 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  23.83 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  24.51 
 
 		 649 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  23.75 
 
 		 566 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  25.2 
 
 		 651 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  24.76 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  25 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  23.88 
 
 		 564 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  22.71 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  26.24 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  28.32 
 
 		 605 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  24.79 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  23.63 
 
 		 646 aa  63.9  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  24 
 
 		 563 aa  62  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  26.99 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  26.9 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  26.42 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  26.67 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  27.45 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  26.67 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  28.66 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  24.59 
 
 		 564 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  23.71 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  23.32 
 
 		 538 aa  57  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  21.67 
 
 		 692 aa  57  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  25.74 
 
 		 567 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  25 
 
 		 618 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  28.85 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  22.31 
 
 		 529 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  23.53 
 
 		 436 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 568 aa  53.9  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  27.06 
 
 		 662 aa  53.9  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  22.89 
 
 		 529 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  27.88 
 
 		 456 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  24.02 
 
 		 687 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  30.58 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  27.39 
 
 		 657 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  25.58 
 
 		 602 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  25.43 
 
 		 581 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1429  integrase family protein  22.96 
 
 		 578 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  22.28 
 
 		 388 aa  50.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  19.9 
 
 		 550 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  25 
 
 		 720 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  21.32 
 
 		 290 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  22.63 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  22.34 
 
 		 509 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  26.79 
 
 		 558 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  23 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1202  integrase family protein  24.34 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  26.35 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  22.83 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  27.43 
 
 		 602 aa  48.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  25.26 
 
 		 566 aa  47.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  27.67 
 
 		 509 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  22.56 
 
 		 565 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  22.89 
 
 		 563 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  25.55 
 
 		 616 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  30.07 
 
 		 344 aa  47  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  20.89 
 
 		 358 aa  47  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.49 
 
 		 347 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  25.55 
 
 		 538 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  26.39 
 
 		 540 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  24.02 
 
 		 386 aa  47  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  23.3 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  22.83 
 
 		 588 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  22.22 
 
 		 635 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  27.13 
 
 		 651 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  24.66 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  36.23 
 
 		 549 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  21.35 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  24.48 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  35.62 
 
 		 692 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  25 
 
 		 602 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  25.53 
 
 		 354 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  27.33 
 
 		 533 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  24.87 
 
 		 284 aa  45.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  22.33 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  23.39 
 
 		 344 aa  44.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  28 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  25.17 
 
 		 599 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  29.17 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  23.2 
 
 		 589 aa  43.9  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  22.28 
 
 		 637 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>