103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4209 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  631  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  70.45 
 
 		 441 aa  431  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  37.38 
 
 		 538 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  35.83 
 
 		 509 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  35.02 
 
 		 599 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  32.01 
 
 		 424 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  33.12 
 
 		 563 aa  139  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  30.16 
 
 		 558 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  30.67 
 
 		 515 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  32.26 
 
 		 529 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  31.17 
 
 		 529 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  26.95 
 
 		 584 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  28.62 
 
 		 567 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  31.47 
 
 		 566 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  28.52 
 
 		 560 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  26.96 
 
 		 566 aa  86.3  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 538 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  32.04 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  25.44 
 
 		 687 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  30.72 
 
 		 381 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  27.46 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  26.64 
 
 		 602 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  30.11 
 
 		 588 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  31.61 
 
 		 602 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  24.44 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  24.28 
 
 		 434 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  25.69 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  27.4 
 
 		 618 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  25.96 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  27.39 
 
 		 498 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  23.63 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  24.91 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  44.12 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  27.67 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  26.92 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  26.56 
 
 		 535 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  27.36 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  30.69 
 
 		 559 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  29.94 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  25.82 
 
 		 587 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  29.78 
 
 		 581 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  25.87 
 
 		 556 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  25.87 
 
 		 649 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  28.93 
 
 		 646 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  21.82 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  26.61 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  22.78 
 
 		 588 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  25.19 
 
 		 605 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  25.59 
 
 		 527 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  23.21 
 
 		 456 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  25.26 
 
 		 386 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  27.78 
 
 		 565 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  28.1 
 
 		 290 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  25.23 
 
 		 548 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  21.89 
 
 		 651 aa  52.8  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 499 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  24.61 
 
 		 635 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  24.24 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  22.86 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  20.96 
 
 		 430 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  23.97 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  23.42 
 
 		 533 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  25.44 
 
 		 550 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  24.26 
 
 		 508 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  24.26 
 
 		 508 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 430 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  26.4 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  24.84 
 
 		 593 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  23.89 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  25.86 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  27.13 
 
 		 616 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  26.53 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  26.53 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  21.05 
 
 		 430 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  30.41 
 
 		 268 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  24.18 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  26.23 
 
 		 458 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  28.15 
 
 		 509 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0436  hypothetical protein  31.91 
 
 		 99 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  24.55 
 
 		 298 aa  46.2  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  31.76 
 
 		 662 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  20.37 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  25 
 
 		 619 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  29.53 
 
 		 568 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  27.32 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.08 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  25.17 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  24.57 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.08 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.08 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  28.09 
 
 		 692 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  26.04 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  25 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  25 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  27.05 
 
 		 540 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  21.71 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  19.71 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0993  integrase family protein  23.68 
 
 		 320 aa  42.7  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00576914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>