32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1902 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1902  phage integrase  100 
 
 		 422 aa  858    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183596  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1997  phage integrase  63.74 
 
 		 422 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.559264  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3521  phage integrase  62.56 
 
 		 422 aa  523  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222857 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  55.9 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  35.23 
 
 		 454 aa  236  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6823  integrase family protein  40.06 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3428  phage integrase protein  35.7 
 
 		 440 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0192  integrase family protein  33.85 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3509  putative phage integrase family protein  54.88 
 
 		 190 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1310  hypothetical protein  27.88 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1842  putative phage integrase family protein  51.85 
 
 		 113 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  26.87 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  29.47 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  31.16 
 
 		 490 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  31.87 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0788  Phage integrase  26.88 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  26.82 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  25.17 
 
 		 387 aa  49.7  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  27.03 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  22.73 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  25.95 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  24.81 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  28.95 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  23.91 
 
 		 451 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  24.75 
 
 		 635 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  25.6 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  28.38 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  24.66 
 
 		 566 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  30.64 
 
 		 646 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1223  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  29.24 
 
 		 308 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>