72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0676 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  100 
 
 		 363 aa  743    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  99.32 
 
 		 296 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  78.79 
 
 		 361 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  54.67 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  38.15 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  40.35 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  31.99 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  32.93 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  30.75 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  34.22 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  34.96 
 
 		 426 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  34.02 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  34.45 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  35.16 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  33.43 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  35.91 
 
 		 389 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  33.78 
 
 		 294 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  29.34 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  33.06 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  29.28 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  27.12 
 
 		 250 aa  86.7  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  30.18 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  31.05 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  34.92 
 
 		 164 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  36.61 
 
 		 125 aa  70.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  28.17 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  31.05 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  31.5 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  31.32 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  29.54 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  33.98 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.84 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25.5 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  27.68 
 
 		 373 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  25.72 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  26.05 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  24.89 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.81 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.81 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0569  integrase family protein  26.57 
 
 		 251 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0286562 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.07 
 
 		 305 aa  49.7  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  25.11 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  24.57 
 
 		 487 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  24.33 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.13 
 
 		 347 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  21.4 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  31.25 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  28.77 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  24.52 
 
 		 326 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  23.83 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  28.97 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  22.85 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  25.08 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  19.83 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  25.52 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  24.22 
 
 		 643 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  25.52 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0755  putative tyrosine recombinase  34.15 
 
 		 101 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313446  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  25.48 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 278 aa  43.9  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  22.45 
 
 		 332 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  22.74 
 
 		 644 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  24.27 
 
 		 286 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  26.4 
 
 		 384 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  20.18 
 
 		 285 aa  43.1  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2277  phage integrase  26.79 
 
 		 310 aa  42.7  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000555272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  27.74 
 
 		 332 aa  42.7  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>