96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2519 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  100 
 
 		 346 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  70.66 
 
 		 344 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  65.19 
 
 		 385 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  41.25 
 
 		 370 aa  228  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  40.65 
 
 		 370 aa  226  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  39.66 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  39.83 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  42.73 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  35.01 
 
 		 344 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  40.68 
 
 		 250 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  33.53 
 
 		 367 aa  162  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  37.1 
 
 		 426 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  32.75 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  35.45 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  34.4 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  34.8 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  31.01 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  33.22 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  30.14 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  29.01 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  35.09 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  28.82 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  28.66 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  30.56 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  32.28 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  33.18 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  32.74 
 
 		 363 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  29.87 
 
 		 351 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  30.47 
 
 		 373 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  31.07 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  29.5 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  30 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  33.5 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  30.88 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  28.34 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  30.25 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  27.3 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  27.39 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  24.48 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  29.38 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0910  putative integrase  37.89 
 
 		 95 aa  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.690439  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  26.43 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  24.81 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  27.08 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  25.44 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  27.43 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  27.85 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  24.63 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  24.91 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  26.37 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  22.94 
 
 		 421 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 437 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  26.05 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  25.76 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  28.89 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 303 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  27.72 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3692  integrase family protein  30.28 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  32.39 
 
 		 164 aa  50.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  27.23 
 
 		 309 aa  49.7  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  23.29 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  23.38 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  24.18 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  23.47 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  27.41 
 
 		 428 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  26.6 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 413 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  26.6 
 
 		 331 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  30.43 
 
 		 414 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  26.94 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  23.9 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  23.42 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.3 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  28.1 
 
 		 197 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  26.77 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  21.28 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  24.5 
 
 		 538 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  28.43 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1863  integrase family protein  28.86 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0755  putative tyrosine recombinase  34.04 
 
 		 101 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313446  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  22.84 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  27.59 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  26.46 
 
 		 588 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  32.52 
 
 		 125 aa  43.5  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  22.84 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  29.36 
 
 		 456 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.85 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  29.36 
 
 		 451 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  26.15 
 
 		 433 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  29.36 
 
 		 451 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>