85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2475 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  100 
 
 		 345 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  76.45 
 
 		 311 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  41.02 
 
 		 373 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  40.48 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  39.17 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  40.54 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  39.27 
 
 		 360 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  39.94 
 
 		 349 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  32.53 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  30.51 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  28.28 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  28.53 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  27.01 
 
 		 351 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  26.2 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  29.02 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  23.5 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  26.62 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  26.42 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  28.01 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  26.47 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  23.63 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  24.26 
 
 		 388 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  25.66 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  28.46 
 
 		 385 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  22.92 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  23.36 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  26.83 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  25.18 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  23.83 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  25.1 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  24.12 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  29.36 
 
 		 374 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  24.06 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  28.17 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  25.35 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.51 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  28.51 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  27.4 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  23.55 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  23.87 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  25.63 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  23.26 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  21.86 
 
 		 426 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.46 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  26.43 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  25.39 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  21.47 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  27.04 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  23.73 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  25.86 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  26 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  29.69 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  26.73 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  26.73 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  26.73 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  26.26 
 
 		 463 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.24 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.73 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  27.43 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  26.73 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  26.73 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  25.5 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  26.06 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.81 
 
 		 431 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  24.87 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1202  integrase family protein  24.84 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  26.03 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  23.43 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.44 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1375  phage integrase family protein  27.09 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  26.14 
 
 		 200 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  26.4 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  22.83 
 
 		 344 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  29.56 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.11 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  25.95 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1741  Phage integrase  28.48 
 
 		 278 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  22.87 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  22.69 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2582  integrase  27.59 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000812443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  31.75 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>