270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3294 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  100 
 
 		 360 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  81.89 
 
 		 373 aa  591  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  82.17 
 
 		 360 aa  577  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  55.65 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  50.89 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  42.4 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  39.82 
 
 		 344 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  39.27 
 
 		 345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  40.53 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  36.44 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  34.65 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  30.86 
 
 		 351 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  36.11 
 
 		 277 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  31 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  26.13 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  29.37 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  30.72 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  26.98 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  26.91 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  27.99 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  27.06 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  27.35 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1741  Phage integrase  28.39 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  28.36 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  29.14 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  26.16 
 
 		 421 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  26.36 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  25.73 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  29.91 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  28.66 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  27.27 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  25.24 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  30 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  30.2 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  26.81 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  26.73 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  26.12 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  30.04 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  31.62 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1375  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  27.8 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  27.51 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  32.53 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  27.46 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  24.86 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  26.34 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  33.82 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  28.1 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  23.87 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  23.14 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  28.92 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  27.63 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  26.89 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  32.61 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  24.77 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  24.48 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  25.42 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  30.41 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  27.92 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  28.42 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  27.35 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.71 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  32.54 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  27.06 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  27.66 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  25 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  25 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  24.65 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  23.74 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.63 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  28.95 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 200 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.04 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.37 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  31.41 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  26.32 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  26.25 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  26.25 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  32.26 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  26.32 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  25.38 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  23.38 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.38 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  32.91 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  26.27 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.29 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  25.21 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  24.9 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  23.59 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.71 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>