56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7358 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  100 
 
 		 344 aa  692    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  75.44 
 
 		 385 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  70.66 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  40.77 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  40.48 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  39.83 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  39.71 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  44.76 
 
 		 250 aa  189  7e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  39.64 
 
 		 359 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  33.04 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  34.32 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  32.06 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  36.9 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  33.33 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  39.91 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  31.74 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  32.5 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  30.95 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  28.35 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  30.59 
 
 		 361 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  27.94 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  33.04 
 
 		 363 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  32.6 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  29.19 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  30.52 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  30.41 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  28.52 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  28.03 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  29.61 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  25 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  27.63 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  24.92 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0910  putative integrase  41.05 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.690439  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  23.4 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  22.91 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  27.34 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  30.64 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  26.89 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  24.21 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  23.62 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  22.9 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  25.53 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  23.53 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 283 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  23.51 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  26.96 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  29.14 
 
 		 197 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  25.81 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  23.83 
 
 		 359 aa  43.1  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  24.14 
 
 		 325 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>