More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0218 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0218  integrase family protein  100 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0399465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2409  integrase family protein  66.67 
 
 		 197 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1056  integrase family protein  66.14 
 
 		 197 aa  256  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0180759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2871  integrase family protein  63.02 
 
 		 198 aa  254  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0776  hypothetical protein  61.11 
 
 		 188 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.371446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0839  DNA recombinase HbiF  61.11 
 
 		 188 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0873  HbiF  61.11 
 
 		 188 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102979  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4838  tyrosine recombinase  53.33 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5818  tyrosine recombinase  53.33 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.855252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4538  tyrosine recombinase  53.33 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000945122  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3686  integrase family protein  52.78 
 
 		 200 aa  201  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0366  phage integrase family site specific recombinase  53.8 
 
 		 173 aa  201  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.61457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04182  tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA  50.81 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04144  hypothetical protein  50.81 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4839  tyrosine recombinase  50.81 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4539  tyrosine recombinase  50.81 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00145575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5819  tyrosine recombinase  50.27 
 
 		 198 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.97237 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2512  type 1 fimbriae regulatory protein  50.27 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570306  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3684  integrase family protein  54.32 
 
 		 183 aa  187  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4235  integrase family protein  55.92 
 
 		 153 aa  178  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.407611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2513  type 1 fimbriae regulatory protein  46.96 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2413  integrase family protein  50 
 
 		 182 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04141  hypothetical protein  48.34 
 
 		 159 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2682  integrase family protein  38.71 
 
 		 193 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5359  integrase family protein  38.8 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  33.87 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0016  Phage integrase  36.65 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0260754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  36.51 
 
 		 313 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.28 
 
 		 284 aa  100  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.59 
 
 		 317 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.87 
 
 		 314 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.95 
 
 		 318 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.95 
 
 		 318 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  35.91 
 
 		 302 aa  97.1  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  33.52 
 
 		 313 aa  97.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  35.96 
 
 		 301 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.41 
 
 		 318 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.41 
 
 		 311 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  35.08 
 
 		 311 aa  96.3  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.61 
 
 		 296 aa  94.7  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  35.03 
 
 		 308 aa  94.7  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.93 
 
 		 308 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.61 
 
 		 296 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.81 
 
 		 298 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  36.92 
 
 		 308 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  34.88 
 
 		 299 aa  92.8  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  35.43 
 
 		 298 aa  92.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  92.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  92.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  92.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  38.38 
 
 		 317 aa  92.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  33.72 
 
 		 303 aa  92  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.11 
 
 		 299 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  35.22 
 
 		 311 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.11 
 
 		 299 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  36.84 
 
 		 312 aa  90.5  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.57 
 
 		 301 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.57 
 
 		 299 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.57 
 
 		 299 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.57 
 
 		 299 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.57 
 
 		 299 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.17 
 
 		 321 aa  89.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.57 
 
 		 299 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  31.03 
 
 		 298 aa  89.4  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.98 
 
 		 313 aa  89.4  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  33.9 
 
 		 344 aa  89  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  31.61 
 
 		 307 aa  89  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  35.5 
 
 		 293 aa  89  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  32.39 
 
 		 277 aa  89  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  33.71 
 
 		 293 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  35.09 
 
 		 302 aa  89  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  31.61 
 
 		 307 aa  88.6  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  31.58 
 
 		 315 aa  88.6  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 299 aa  88.6  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  32.29 
 
 		 362 aa  88.6  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  29.05 
 
 		 291 aa  88.6  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 299 aa  88.2  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  31.09 
 
 		 307 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 299 aa  88.2  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  33.52 
 
 		 303 aa  88.2  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  29.84 
 
 		 302 aa  88.2  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  33.52 
 
 		 303 aa  88.2  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.84 
 
 		 302 aa  87.8  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  32.54 
 
 		 324 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  35.16 
 
 		 298 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 296 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  31.82 
 
 		 299 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  33.33 
 
 		 298 aa  87  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 299 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  29.84 
 
 		 302 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  34.04 
 
 		 306 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 299 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  31.49 
 
 		 297 aa  87  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  32.82 
 
 		 318 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>