More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2413 on replicon NC_011667
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2413  integrase family protein  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0776  hypothetical protein  56.35 
 
 		 188 aa  203  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.371446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0839  DNA recombinase HbiF  56.35 
 
 		 188 aa  203  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0873  HbiF  56.35 
 
 		 188 aa  203  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102979  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2409  integrase family protein  54.44 
 
 		 197 aa  184  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1056  integrase family protein  54.44 
 
 		 197 aa  184  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0180759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04182  tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA  51.91 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4839  tyrosine recombinase  51.91 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04144  hypothetical protein  51.91 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4539  tyrosine recombinase  51.91 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00145575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2512  type 1 fimbriae regulatory protein  48.11 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5819  tyrosine recombinase  51.91 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.97237 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0366  phage integrase family site specific recombinase  55.06 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.61457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2871  integrase family protein  51.37 
 
 		 198 aa  180  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4538  tyrosine recombinase  49.16 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000945122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5818  tyrosine recombinase  49.16 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.855252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4838  tyrosine recombinase  49.16 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2513  type 1 fimbriae regulatory protein  45.56 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3686  integrase family protein  48.6 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73173  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5359  integrase family protein  51.67 
 
 		 204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2682  integrase family protein  50.56 
 
 		 193 aa  171  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3684  integrase family protein  55 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0218  integrase family protein  50 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0399465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4235  integrase family protein  47.68 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.407611 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0016  Phage integrase  45.11 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0260754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04141  hypothetical protein  44.67 
 
 		 159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  37.43 
 
 		 317 aa  98.6  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  35.63 
 
 		 311 aa  91.7  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  36.59 
 
 		 295 aa  89.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.29 
 
 		 308 aa  89  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  30.48 
 
 		 284 aa  88.6  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  37.72 
 
 		 297 aa  87.8  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  41.1 
 
 		 373 aa  87.8  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  38.15 
 
 		 327 aa  87.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  36.26 
 
 		 307 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  35.75 
 
 		 295 aa  86.3  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  31.64 
 
 		 319 aa  86.7  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  35.2 
 
 		 254 aa  85.9  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  34.43 
 
 		 308 aa  85.1  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  35.39 
 
 		 296 aa  85.1  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1146  tyrosine recombinase XerD  36.31 
 
 		 286 aa  85.1  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  33.14 
 
 		 301 aa  84.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  37.24 
 
 		 299 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  35.88 
 
 		 303 aa  84.3  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 317 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  35.88 
 
 		 303 aa  84.3  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.24 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.98 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  35 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  33.7 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2821  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.57 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.626713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  34.94 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  31.76 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  33.51 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  37.58 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  33.15 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.65 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2415  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.86 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  33.15 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.6 
 
 		 302 aa  82  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  34.29 
 
 		 317 aa  82  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  35 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  32.97 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  31.67 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  34.81 
 
 		 303 aa  81.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.65 
 
 		 314 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  29.83 
 
 		 296 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.65 
 
 		 318 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.65 
 
 		 318 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  34.62 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.7 
 
 		 298 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.7 
 
 		 298 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  35.33 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  33.15 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  35.71 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.87 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  33.87 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  28.33 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  32.89 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.55 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  35.47 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  34.81 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  34.08 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  35.47 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  28.89 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  33.15 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.89 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  35 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  36.49 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.11 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  31.75 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  35.17 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  34.64 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.7 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  35.06 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>