More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_04141 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_04141  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  331  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5818  tyrosine recombinase  100 
 
 		 200 aa  330  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.855252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4538  tyrosine recombinase  100 
 
 		 200 aa  330  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000945122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4838  tyrosine recombinase  99.37 
 
 		 200 aa  330  6e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3686  integrase family protein  99.37 
 
 		 200 aa  329  9e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73173  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0776  hypothetical protein  55.26 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.371446 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0873  HbiF  55.26 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102979  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0839  DNA recombinase HbiF  55.26 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2512  type 1 fimbriae regulatory protein  49.03 
 
 		 209 aa  167  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0366  phage integrase family site specific recombinase  53.24 
 
 		 173 aa  154  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.61457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0218  integrase family protein  48.34 
 
 		 191 aa  154  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0399465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2871  integrase family protein  47.68 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2409  integrase family protein  47.68 
 
 		 197 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4235  integrase family protein  54.17 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.407611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04182  tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA  46.05 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4839  tyrosine recombinase  46.05 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04144  hypothetical protein  46.05 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4539  tyrosine recombinase  46.05 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00145575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5819  tyrosine recombinase  46.05 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.97237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1056  integrase family protein  47.02 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0180759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3684  integrase family protein  46.76 
 
 		 183 aa  131  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312945  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2413  integrase family protein  44.67 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2513  type 1 fimbriae regulatory protein  44.44 
 
 		 189 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0016  Phage integrase  41.67 
 
 		 207 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0260754  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2682  integrase family protein  41.03 
 
 		 193 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5359  integrase family protein  37.97 
 
 		 204 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13733 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.08 
 
 		 284 aa  96.7  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  31.33 
 
 		 297 aa  74.7  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  31.79 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  32.21 
 
 		 296 aa  73.9  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  32.5 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.05 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  34.75 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  29.61 
 
 		 309 aa  71.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.05 
 
 		 314 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.61 
 
 		 295 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  29.75 
 
 		 282 aa  71.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.32 
 
 		 301 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.32 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  30.92 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.71 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0382  integrase family protein  28.95 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636105 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  28.57 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  30.37 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  29.22 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.22 
 
 		 299 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  29.88 
 
 		 329 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  32.67 
 
 		 295 aa  67.8  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  30.67 
 
 		 313 aa  67.4  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.41 
 
 		 318 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  28.68 
 
 		 304 aa  67  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  30.46 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  31.48 
 
 		 308 aa  67  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.86 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.8 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  29.14 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.41 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.41 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  30.37 
 
 		 302 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  33.99 
 
 		 295 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 320 aa  65.1  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2031  integrase family protein  29.03 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2399  site-specific recombinase, phage integrase family  29.03 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0509  site-specific recombinase, phage integrase family  29.03 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  34.11 
 
 		 443 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  30.32 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0328  integrase family protein  29.03 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133269 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0833  site-specific recombinase, phage integrase family  29.03 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0667  integrase family protein  29.03 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  30 
 
 		 321 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 299 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  29.61 
 
 		 308 aa  64.7  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  30.2 
 
 		 298 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  31.45 
 
 		 295 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  28.48 
 
 		 314 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 293 aa  64.3  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  31.87 
 
 		 292 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.41 
 
 		 300 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 305 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  29.71 
 
 		 304 aa  63.9  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.39 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  26.67 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.39 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  32.17 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.41 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  31.58 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  29.87 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.41 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.5 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.75 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  31.17 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>