More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4538 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5818  tyrosine recombinase  100 
 
 		 200 aa  416  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.855252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4538  tyrosine recombinase  100 
 
 		 200 aa  416  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000945122  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3686  integrase family protein  99.5 
 
 		 200 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4838  tyrosine recombinase  99.5 
 
 		 200 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04141  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  330  6e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0873  HbiF  60 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102979  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0839  DNA recombinase HbiF  60 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0776  hypothetical protein  60 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.371446 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2512  type 1 fimbriae regulatory protein  52.33 
 
 		 209 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0366  phage integrase family site specific recombinase  57.06 
 
 		 173 aa  204  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.61457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0218  integrase family protein  53.33 
 
 		 191 aa  202  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0399465 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04182  tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA  52.46 
 
 		 198 aa  198  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04144  hypothetical protein  52.46 
 
 		 198 aa  198  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4539  tyrosine recombinase  52.46 
 
 		 198 aa  198  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00145575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4839  tyrosine recombinase  52.46 
 
 		 198 aa  198  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5819  tyrosine recombinase  52.46 
 
 		 198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.97237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2871  integrase family protein  50.27 
 
 		 198 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2409  integrase family protein  51.63 
 
 		 197 aa  194  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1056  integrase family protein  51.09 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0180759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4235  integrase family protein  59.46 
 
 		 153 aa  187  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.407611 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3684  integrase family protein  53.53 
 
 		 183 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2513  type 1 fimbriae regulatory protein  49.73 
 
 		 189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2413  integrase family protein  49.16 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2682  integrase family protein  43.78 
 
 		 193 aa  157  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5359  integrase family protein  41.18 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13733 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0016  Phage integrase  42.26 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0260754  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  30.56 
 
 		 284 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 296 aa  92.8  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.61 
 
 		 317 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.61 
 
 		 314 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.43 
 
 		 301 aa  89  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  31.35 
 
 		 297 aa  89  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.43 
 
 		 299 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0382  integrase family protein  31.95 
 
 		 194 aa  88.6  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636105 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  30.05 
 
 		 295 aa  88.2  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  32.54 
 
 		 254 aa  87  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 311 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  28.26 
 
 		 291 aa  86.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.51 
 
 		 299 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.66 
 
 		 300 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  30.27 
 
 		 304 aa  86.3  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 301 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  33.15 
 
 		 295 aa  85.1  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  31.38 
 
 		 295 aa  85.1  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  28.11 
 
 		 304 aa  85.1  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.35 
 
 		 299 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.09 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  30.59 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.35 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.35 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.09 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  29.95 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.35 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.09 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.41 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.41 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  31.31 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  31.55 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.41 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.96 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  31.67 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  32.54 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  31.95 
 
 		 302 aa  82  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.95 
 
 		 320 aa  82  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.8 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.8 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  31.52 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  29.79 
 
 		 304 aa  82  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  30.81 
 
 		 299 aa  81.6  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  32.22 
 
 		 308 aa  81.6  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  30.53 
 
 		 304 aa  81.6  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.77 
 
 		 300 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  32.68 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.19 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  29.44 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  30.73 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  31.32 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  29.21 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  30.98 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  30.11 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  32.22 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  31.85 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  29.44 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  29.26 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  29.44 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  29.02 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  29.44 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  28.65 
 
 		 307 aa  78.6  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  27.62 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  26.34 
 
 		 299 aa  78.6  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  32.77 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  30.95 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  28.65 
 
 		 307 aa  78.2  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 298 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  32.12 
 
 		 299 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  30.95 
 
 		 321 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 315 aa  77.8  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.65 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>