More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0753 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0753  tyrosine recombinase XerD subunit  100 
 
 
297 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000038176  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  42.38 
 
 
297 aa  258  7e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  41.33 
 
 
302 aa  242  7e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.53 
 
 
298 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  38.38 
 
 
295 aa  236  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  38.64 
 
 
302 aa  233  3e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  40.74 
 
 
296 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.07 
 
 
299 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.58 
 
 
296 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  38.38 
 
 
294 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  225  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  37.71 
 
 
295 aa  225  7e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  39 
 
 
295 aa  225  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  225  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  224  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  224  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
296 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  37.58 
 
 
295 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  37.97 
 
 
296 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  38.26 
 
 
295 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  38.26 
 
 
295 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  38.8 
 
 
294 aa  215  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  37.72 
 
 
294 aa  215  9e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  37.93 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  36.58 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  35.05 
 
 
296 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  36.18 
 
 
299 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  38.93 
 
 
291 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  35.57 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  36.09 
 
 
313 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  36.45 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.96 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.96 
 
 
299 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  34.58 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.96 
 
 
301 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.27 
 
 
299 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.69 
 
 
333 aa  195  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  34.92 
 
 
295 aa  195  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.27 
 
 
299 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  35.62 
 
 
302 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.27 
 
 
299 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.93 
 
 
299 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.27 
 
 
299 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.27 
 
 
299 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.27 
 
 
299 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.27 
 
 
299 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.98 
 
 
305 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  33.99 
 
 
307 aa  192  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  34.36 
 
 
301 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  35.31 
 
 
303 aa  192  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 
292 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  34.6 
 
 
297 aa  191  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  34.22 
 
 
309 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.98 
 
 
305 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.98 
 
 
333 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  36 
 
 
313 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.98 
 
 
333 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  33.99 
 
 
307 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.98 
 
 
333 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.98 
 
 
305 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.98 
 
 
329 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  34.34 
 
 
295 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  33.99 
 
 
307 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  35.69 
 
 
301 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  33.33 
 
 
295 aa  188  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  35.03 
 
 
308 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.48 
 
 
298 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  34.83 
 
 
298 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  36.04 
 
 
296 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  35.12 
 
 
297 aa  186  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1555  tyrosine recombinase XerD  36.7 
 
 
290 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  37.54 
 
 
312 aa  185  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  34.48 
 
 
299 aa  185  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  34.24 
 
 
302 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  34.24 
 
 
302 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.79 
 
 
322 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.52 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  35.54 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.79 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  37.54 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  34.67 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  35.87 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  35.15 
 
 
321 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  36.14 
 
 
312 aa  183  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5891  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.1 
 
 
316 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  33 
 
 
311 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  34.23 
 
 
300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  33 
 
 
295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.79 
 
 
298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  34.56 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.79 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0183983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  38.03 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  34.35 
 
 
309 aa  182  6e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  34.12 
 
 
309 aa  182  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>