115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1129 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 339 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  61.19 
 
 		 341 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  60.6 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  58.75 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  53.75 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  45.65 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  42.5 
 
 		 334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  44.48 
 
 		 338 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  42.39 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  42.09 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  61.14 
 
 		 200 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0995  integrase protein  57.66 
 
 		 147 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000161367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  32.98 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.67 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.3 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  28.49 
 
 		 339 aa  98.6  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  29.92 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  28.16 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  28.12 
 
 		 339 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  27.87 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  28.03 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  27.3 
 
 		 339 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  28.03 
 
 		 339 aa  92.8  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  28.03 
 
 		 339 aa  92.8  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  27.84 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  38.73 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  28.27 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  27.93 
 
 		 349 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  25.9 
 
 		 368 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  26.45 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  26.04 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  26.25 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  24.48 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  25.76 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0555  hypothetical protein  26.38 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178247  normal  0.46728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  24.01 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  23.2 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  25.66 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  25.12 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  21.02 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  24.63 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  24.63 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01326  site-specific recombinase, phage integrase family  23.01 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0890687  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  23.13 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6332  integrase family protein  23.84 
 
 		 423 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  20.7 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  25.82 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  22.71 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  24.38 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  24.41 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  22.73 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  25.35 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  25.35 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1647  integrase domain protein SAM domain protein  25.93 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  25.24 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1734  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  25.24 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  22.1 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  22.27 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  22.58 
 
 		 304 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  41.18 
 
 		 182 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.53 
 
 		 337 aa  52.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  22.5 
 
 		 388 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  20.07 
 
 		 412 aa  52.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  21.74 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04071  site-specific recombinase, phage integrase family  20.75 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0594853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  20 
 
 		 399 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  22.7 
 
 		 402 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  21.43 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  23.92 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  24.38 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1139  phage-related integrase  22.08 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  21.99 
 
 		 444 aa  49.7  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0631  phage-related integrase  21.67 
 
 		 390 aa  49.7  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  24.27 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  22.18 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  22.57 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  22.22 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  22.96 
 
 		 388 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  23.53 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  20.54 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  23.53 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  20.54 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  20.54 
 
 		 399 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  22.44 
 
 		 387 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  20.54 
 
 		 399 aa  46.2  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  22.11 
 
 		 250 aa  46.2  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  19.86 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  22.08 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  22.08 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  19.39 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  23.04 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>