111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4875 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  100 
 
 		 368 aa  762    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  84.19 
 
 		 270 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  82.33 
 
 		 270 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  82.33 
 
 		 270 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  81.6 
 
 		 228 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  81.6 
 
 		 228 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  37.91 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  32.15 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  32.42 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  30.35 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  25.62 
 
 		 359 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  25.07 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  28.42 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  25.49 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  28.31 
 
 		 329 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  26.42 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 338 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  26.98 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  30.52 
 
 		 200 aa  87  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  25.9 
 
 		 339 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  26.17 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  29.45 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  27.36 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  29.11 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  29.45 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  27.76 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  28.77 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  28.77 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  28.42 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  29.41 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.04 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.04 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  30.99 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  27.34 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  23.46 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1203  hypothetical protein  26.45 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000176468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  27.68 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  25.86 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  30.51 
 
 		 323 aa  67  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  26.54 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  31.36 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  26.13 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  25.72 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  24.86 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  28.1 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  23.28 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  26.64 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  29.06 
 
 		 182 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  28.17 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.66 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  26.83 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  27.64 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1734  phage integrase family protein  25 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  26.28 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  28.95 
 
 		 411 aa  57  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0995  integrase protein  27.92 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000161367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.35 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  27.6 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  26.67 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  25.79 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6332  integrase family protein  23.16 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  26.07 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  24.74 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.53 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.53 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  26.82 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.31 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  30 
 
 		 404 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  22.55 
 
 		 337 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  24.56 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  23.27 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  23.02 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  23.57 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.81 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  25.66 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  25.74 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  27.45 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4258  phage integrase family site specific recombinase  27.6 
 
 		 293 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  27.14 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  22.92 
 
 		 342 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  24.86 
 
 		 250 aa  47.4  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  25 
 
 		 228 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0795  integrase family protein  25.32 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  26.07 
 
 		 344 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  32 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 361 aa  46.2  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5393  integrase family protein  21.57 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3097  site-specific recombinase XerD-like protein  22.06 
 
 		 205 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  28.36 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  26.77 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  25.6 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  23.27 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  28.8 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  24.1 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>