33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3025 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  100 
 
 		 351 aa  719    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  37.13 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  34.1 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  32.09 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  33.14 
 
 		 349 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  32.27 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  31.14 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  31.58 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  28.82 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  28.31 
 
 		 346 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  27.38 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  26.12 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  27.54 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  26.23 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  30.34 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  35 
 
 		 370 aa  53.1  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  35.45 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  20.92 
 
 		 421 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  23.77 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  23.17 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  26.02 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2191  Phage integrase  29.41 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  27.81 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  27.81 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  23.91 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  25.68 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  23.5 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  25.44 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  27.83 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.94 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  31.17 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.88 
 
 		 370 aa  42.7  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>