141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2301 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  100 
 
 		 329 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  58.66 
 
 		 341 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  57.45 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  54.74 
 
 		 342 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  86.84 
 
 		 200 aa  358  7e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  53.75 
 
 		 339 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  45.92 
 
 		 338 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  45.05 
 
 		 338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  44.91 
 
 		 338 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  44.61 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  41.14 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0995  integrase protein  61.54 
 
 		 147 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000161367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  33.11 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.19 
 
 		 344 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  28.31 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.41 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  33.59 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  33.59 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  33.59 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  33.33 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  34.85 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  33.33 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  33.98 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  28.57 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  34.01 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  28.31 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  34.8 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  26.57 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  27.85 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  31.2 
 
 		 349 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  27.64 
 
 		 349 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  28 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  27 
 
 		 373 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  25.36 
 
 		 356 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  28.69 
 
 		 360 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  37.76 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  28.17 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  24.67 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01326  site-specific recombinase, phage integrase family  25.8 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0890687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04071  site-specific recombinase, phage integrase family  22.8 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0594853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0555  hypothetical protein  26.51 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178247  normal  0.46728 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  25.82 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  25.82 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  25.32 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  27.31 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  25.71 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  25.71 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  24.57 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  26.25 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  25.18 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  30.16 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  26.59 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  26.67 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  31.79 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  22.49 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  24.72 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  23.57 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  24.4 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  31.4 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  31.14 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1647  integrase domain protein SAM domain protein  26.6 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0631  phage-related integrase  23.72 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  22.08 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  26.92 
 
 		 341 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  24.25 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  24.14 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1139  phage-related integrase  23.72 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  30.58 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  24.18 
 
 		 400 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  28.68 
 
 		 400 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 400 aa  52.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  22.76 
 
 		 260 aa  52.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  23.95 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  22.61 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  23.48 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.71 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  22.7 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  22.7 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  22.7 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  22.7 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  25 
 
 		 467 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  24.29 
 
 		 397 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  23.55 
 
 		 284 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  24.44 
 
 		 411 aa  50.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  23.76 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  28.1 
 
 		 398 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 395 aa  49.7  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1203  hypothetical protein  24.53 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000176468  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  25.38 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.79 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6332  integrase family protein  22.93 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  26 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  25.86 
 
 		 412 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  26 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1455  integrase family protein  30.3 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>