20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1741 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1741  Phage integrase  100 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  28.39 
 
 		 360 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  28.23 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  26.89 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  29.02 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  34.32 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  25.22 
 
 		 346 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  27.02 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  32.57 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  29.07 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  25.81 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  29.76 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  31.78 
 
 		 359 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  25 
 
 		 389 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  24.61 
 
 		 335 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  28.57 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  26.58 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3883  putative site-specific integrase/recombinase  50 
 
 		 66 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.353137  normal  0.0700878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  24.88 
 
 		 333 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4252  integrase family protein  46 
 
 		 132 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.354411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>