133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3269 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  100 
 
 		 465 aa  939    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3437  integrase family protein  65.49 
 
 		 458 aa  584  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  43.38 
 
 		 471 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  43.16 
 
 		 471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  32.4 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  34.04 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  36.72 
 
 		 431 aa  100  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.39 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  30.96 
 
 		 409 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.96 
 
 		 369 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  32.11 
 
 		 403 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  31.98 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  28.82 
 
 		 387 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  31.9 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.91 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  31.47 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.96 
 
 		 390 aa  90.5  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  33.16 
 
 		 477 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  31.47 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  26.5 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.67 
 
 		 325 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  30.34 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  25.84 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  26.01 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.43 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  27.11 
 
 		 656 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  28.28 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  30.13 
 
 		 379 aa  79.7  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  26.54 
 
 		 506 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  29.75 
 
 		 378 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.13 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  29.17 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  30.46 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.58 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  27.97 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  37.43 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.59 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  28.8 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  28.97 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.67 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.25 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.25 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.16 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  28.75 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  27.9 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  31.43 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  32.05 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.68 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  22.33 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  27.27 
 
 		 507 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  33.92 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  21.27 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.82 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  31.52 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  32.95 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.23 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  26.47 
 
 		 379 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 379 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  32.46 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.92 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.3 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  26.51 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.21 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  23.7 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  35.53 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.8 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  26.83 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  28.24 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  23.39 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  29.55 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.86 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  23.08 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  24.7 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.26 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  21.98 
 
 		 373 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  24.12 
 
 		 508 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  24.12 
 
 		 508 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  27.23 
 
 		 323 aa  53.9  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  21.51 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  23.77 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.25 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  27.01 
 
 		 451 aa  51.2  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  26.9 
 
 		 376 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  27.71 
 
 		 338 aa  50.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.67 
 
 		 376 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.26 
 
 		 391 aa  50.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  27.75 
 
 		 443 aa  50.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.27 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  28.44 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1993  phage integrase family site specific recombinase  28.67 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  23.56 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.21 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  24.28 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  23.94 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  26.23 
 
 		 443 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  32.05 
 
 		 357 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.45 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>