More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1995 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  100 
 
 		 359 aa  736    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  41.64 
 
 		 369 aa  239  5e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  29.94 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  31.76 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.54 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  31.54 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.08 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  30.45 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  34.55 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  26.76 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  26.45 
 
 		 431 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  26.2 
 
 		 426 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  27.55 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  27.54 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  26.2 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  30.35 
 
 		 396 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  25.54 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  24.93 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  25.43 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  24.64 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  28.68 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  23.86 
 
 		 446 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  23.86 
 
 		 430 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  23.86 
 
 		 446 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  30.2 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  31.13 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  24.74 
 
 		 412 aa  97.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  33.16 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  27.16 
 
 		 375 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  33.52 
 
 		 401 aa  93.2  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  27.81 
 
 		 381 aa  92.8  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  23.78 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  31.34 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  25.34 
 
 		 452 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  30.71 
 
 		 433 aa  90.5  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  27.43 
 
 		 255 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  26.42 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  25.32 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  25.32 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  25.32 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  28.96 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  31.52 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  28.38 
 
 		 369 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.45 
 
 		 369 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  22.88 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  28.41 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  26.88 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  28.04 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  27.78 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  25.99 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  29.57 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.06 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  24.3 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  25.79 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  24.83 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  21.66 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  21.66 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  26.44 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  27.31 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  23.92 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.83 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.68 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  28.32 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  26.48 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.64 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  28.88 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  27.03 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  24.59 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  26.98 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  23.6 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.26 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.26 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  27.54 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  24.81 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.19 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.35 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  25.4 
 
 		 273 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  25.09 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  27.57 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  28.41 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.84 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  28.42 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  27.12 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  27.34 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.36 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.84 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.84 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  25.34 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  25.34 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  22.6 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.67 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.91 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.64 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.25 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.17 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  24.81 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2582  integrase  27.95 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000812443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  23.92 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>