More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_A0232 on replicon NC_005707
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011655  BCAH187_C0189  integrase/recombinase, putative  100 
 
 
347 aa  712    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122412  hitchhiker  3.7857800000000004e-44 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0232  integrase/recombinase, putative  100 
 
 
347 aa  712    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000342454  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0234  phage integrase family protein  88.47 
 
 
347 aa  642    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.92147e-39 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0182  integrase/recombinase  96.53 
 
 
317 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.44216  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0057  integrase-recombinase  30.72 
 
 
381 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0945594  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5606  integrase family protein  28.99 
 
 
390 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0056  integrase-recombinase  28.62 
 
 
390 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0611528  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5368  integrase family protein  28.37 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196734  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.88 
 
 
282 aa  92.4  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 
310 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.11 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  30.96 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.21 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.21 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.21 
 
 
299 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.21 
 
 
299 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  29.86 
 
 
327 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 
312 aa  86.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  28.11 
 
 
311 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.76 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.86 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.76 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  25 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  26.04 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  27.74 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  25 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  27.24 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  24.91 
 
 
308 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  27.74 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  25.8 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  25.53 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  25.89 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.05 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.3 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  27.96 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  25.4 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  26.47 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  29.96 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  26.55 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  25.8 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  25.37 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.42 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  27.4 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  24.09 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.11 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.74 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.74 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.42 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  26.33 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.82 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.5 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  27.56 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  25 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  28 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  27.86 
 
 
305 aa  77  0.0000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.99 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  26.75 
 
 
301 aa  77  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.25 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  26.1 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  26.24 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.78 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  26.5 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  25.45 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  26.01 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  29.29 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  25.37 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  24.92 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.47 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  26.14 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  26.28 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  25.26 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.73 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  25.82 
 
 
300 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  26.14 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  25.71 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  25.16 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  24.37 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  25.56 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  26.69 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  25.08 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  24.82 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  27.5 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.37 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  23.29 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  35.06 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  27.76 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24.91 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.3 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  25.82 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  25.27 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  25.69 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>