More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1288 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1288  integrase family protein  100 
 
 		 382 aa  763    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00250501  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2246  integrase family protein  97.64 
 
 		 382 aa  744    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1673  integrase family protein  50 
 
 		 374 aa  330  3e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  27.24 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  22.49 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  25 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 297 aa  87  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  22.57 
 
 		 308 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.15 
 
 		 295 aa  86.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  23.79 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  22.39 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  23.75 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  25.38 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  24.59 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2195  integrase family protein  24.44 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  21.82 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  22.08 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  24.16 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  21.6 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  24.92 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  24.92 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  21.07 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  25.63 
 
 		 291 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  24.71 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  20.06 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  20.26 
 
 		 312 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  25.21 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  25.23 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  21.59 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  23.72 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  21.43 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  19.39 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.2 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  21.13 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24.92 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.38 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  21.47 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  25.3 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  19.51 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  22.53 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  24.44 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.57 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.57 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.57 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  20.25 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.57 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  25.32 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  23.02 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  24.83 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  22.35 
 
 		 315 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  27.01 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.01 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.71 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  23.66 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  22.07 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  23.68 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  24.43 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.91 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.68 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  25.7 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  21.69 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.17 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  20.8 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  26.25 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  23.82 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  23.04 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  20.36 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  22 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  24.14 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.25 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  21.73 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  21.3 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.91 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  26.2 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.43 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  26.2 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.77 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.77 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.77 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  22.18 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.77 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  22.44 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.77 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.29 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  26.57 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  17.94 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  23.78 
 
 		 294 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  21.59 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  24.18 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.43 
 
 		 296 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.08 
 
 		 306 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  19.67 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  26.21 
 
 		 300 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  20.49 
 
 		 303 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  25.57 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  20.49 
 
 		 303 aa  72  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>