More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5218 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5218  integrase family protein  100 
 
 		 326 aa  663    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  31.09 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  30.9 
 
 		 286 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  27.99 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.27 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  30.38 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  28.62 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  28.28 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  34.27 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.9 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  28.06 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.22 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  30.28 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  31.3 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.06 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  31.42 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  35.32 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  31.72 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  30.93 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.06 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  30.53 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  28.15 
 
 		 283 aa  99.4  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  35.56 
 
 		 322 aa  99  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  30.98 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  32.16 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  34.88 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  30.86 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  32.18 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.3 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.39 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.61 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  30.42 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  29.6 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  30.63 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  31.62 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  28.48 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  32.65 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.58 
 
 		 299 aa  96.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  31.48 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  30.82 
 
 		 299 aa  96.3  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  32.62 
 
 		 295 aa  95.9  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  31.46 
 
 		 299 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.56 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  30.27 
 
 		 395 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.87 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  28.29 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.22 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  29.35 
 
 		 303 aa  95.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  30.59 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3189  integrase family protein  31.12 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000247196  hitchhiker  0.000000000920932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  32.5 
 
 		 299 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  30.2 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.75 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  30.38 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.45 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  33.44 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.75 
 
 		 299 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  28.71 
 
 		 302 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  26.2 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.88 
 
 		 299 aa  92.4  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19700  site-specific recombinase XerD  27.66 
 
 		 354 aa  92.4  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0129569 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.88 
 
 		 299 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.88 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.88 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.48 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  28.28 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  31.66 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  30.16 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.59 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  32.59 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.59 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.88 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.34 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.59 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.59 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.59 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.68 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  32.59 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  34.18 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.75 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.59 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  31.06 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  28.4 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  28.57 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.56 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3619  phage integrase family protein  30.72 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  32.42 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.23 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>