More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2367 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2367  phage integrase family protein  100 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.683007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2529  integrase family protein  36.92 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2790  TOBE domain-containing protein  43.39 
 
 		 438 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  44.57 
 
 		 362 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  43.39 
 
 		 378 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  40.4 
 
 		 452 aa  121  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3517  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.92 
 
 		 380 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3411  TOBE domain protein  32.8 
 
 		 359 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2199  TOBE domain-containing protein  37.23 
 
 		 356 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1780  TOBE domain protein  28.89 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0342  integrase family protein  32.09 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  27.27 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  33.56 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  31.76 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  31.97 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.75 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  30.38 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  28.75 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.91 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  28.75 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  30.56 
 
 		 306 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  28.75 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  30.56 
 
 		 306 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  30.56 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  29.06 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  30.87 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.13 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1434  integrase family protein  26.67 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  33.96 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  30.87 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  31.21 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.33 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  32.93 
 
 		 310 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  29.86 
 
 		 306 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  36.79 
 
 		 331 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3762  phage integrase  31.58 
 
 		 379 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  33.55 
 
 		 374 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2216  integrase family protein  29.27 
 
 		 349 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000229864 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  27.78 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  31.61 
 
 		 367 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0330  integrase family protein  32.26 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  32.35 
 
 		 329 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  33.73 
 
 		 310 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  44.83 
 
 		 337 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  29.22 
 
 		 296 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  33.13 
 
 		 647 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  33.13 
 
 		 647 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  33.13 
 
 		 647 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  43.33 
 
 		 159 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  29.86 
 
 		 299 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  44.83 
 
 		 337 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.25 
 
 		 330 aa  52.4  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  44.83 
 
 		 337 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  44.83 
 
 		 337 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 293 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  29.22 
 
 		 296 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2383  integrase family protein  28.04 
 
 		 338 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000443336  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  28.77 
 
 		 299 aa  52  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  30.82 
 
 		 336 aa  51.6  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  27.67 
 
 		 304 aa  51.6  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  28.12 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  30.83 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  30.15 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  33.73 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  30.9 
 
 		 392 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  30.63 
 
 		 309 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.51 
 
 		 397 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  30.07 
 
 		 324 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.03 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  31.95 
 
 		 335 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  56.41 
 
 		 409 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  28.74 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8257  integrase/recombinase  38.71 
 
 		 109 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0245886  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 443 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  32.39 
 
 		 408 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2316  phage integrase  24.86 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  29.86 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.89 
 
 		 300 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0131  integrase family protein  31.54 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.144823 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 319 aa  50.1  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  26.71 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  28.57 
 
 		 292 aa  49.7  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.94 
 
 		 298 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 364 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 364 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0245  integrase family protein  30.25 
 
 		 333 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  33.12 
 
 		 413 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  28.69 
 
 		 308 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  25.12 
 
 		 322 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  31.82 
 
 		 344 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  39.81 
 
 		 304 aa  49.3  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.94 
 
 		 322 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  27.44 
 
 		 292 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  29.25 
 
 		 324 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  37.86 
 
 		 303 aa  48.9  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  31.58 
 
 		 309 aa  48.9  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  38.71 
 
 		 308 aa  48.9  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.89 
 
 		 315 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  26.9 
 
 		 256 aa  48.9  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>