More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2199 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2199  TOBE domain-containing protein  100 
 
 		 356 aa  697    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  52.76 
 
 		 362 aa  348  8e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3411  TOBE domain protein  41.39 
 
 		 359 aa  242  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  38.89 
 
 		 378 aa  209  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  39.42 
 
 		 452 aa  209  8e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3517  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  39.69 
 
 		 380 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2790  TOBE domain-containing protein  41.79 
 
 		 438 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  34.33 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2367  phage integrase family protein  37.23 
 
 		 211 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.683007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  40.15 
 
 		 141 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  45 
 
 		 268 aa  92.8  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  40.88 
 
 		 142 aa  89.7  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 290 aa  90.1  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  39.86 
 
 		 281 aa  89.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  38.73 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  42.22 
 
 		 142 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 278 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1780  TOBE domain protein  28.57 
 
 		 335 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  38.69 
 
 		 141 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  46.31 
 
 		 269 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 278 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  38.69 
 
 		 141 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  42.45 
 
 		 142 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 278 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.96 
 
 		 141 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  37.96 
 
 		 141 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  39.19 
 
 		 278 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  37.96 
 
 		 141 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  38.69 
 
 		 141 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  38.99 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  37.78 
 
 		 155 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  44 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  44 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  40.58 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  39.58 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  40.58 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  40.58 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  40.58 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  40.58 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2529  integrase family protein  31.98 
 
 		 218 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  40.15 
 
 		 141 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  39.86 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  39.86 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  41.61 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  39.42 
 
 		 177 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  39.42 
 
 		 142 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  38.69 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  38.52 
 
 		 141 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1175  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.5 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0871  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.96 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180666  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 276 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  37.96 
 
 		 140 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  35.82 
 
 		 138 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  38.41 
 
 		 143 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  37.76 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  33.14 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  36.5 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1548  molybdenum-pterin binding protein  35.04 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.98183  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  31.25 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  36.03 
 
 		 270 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.42 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  36.3 
 
 		 142 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.67 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  33.57 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  36.5 
 
 		 142 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  32.61 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  36.11 
 
 		 263 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0788  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2881  transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000144972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0784  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.72 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.72 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2901  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.052498  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  30 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0864  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.72 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0682  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  35.29 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  32.59 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  29.41 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  30.07 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>