More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2529 on replicon NC_013224
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013224  Dret_2529  integrase family protein  100 
 
 		 218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2367  phage integrase family protein  36.92 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.683007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2790  TOBE domain-containing protein  36.22 
 
 		 438 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  36.46 
 
 		 452 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  35.05 
 
 		 378 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  35.08 
 
 		 362 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3517  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  32.51 
 
 		 380 aa  91.7  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2199  TOBE domain-containing protein  31.98 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3411  TOBE domain protein  28.57 
 
 		 359 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.58 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  29.09 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  34.84 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  31.25 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  34.08 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  29.46 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0569  integrase family protein  26.81 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0286562 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  31.52 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  29.46 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1780  TOBE domain protein  26.7 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  34.64 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  28.18 
 
 		 336 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  33.75 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2216  integrase family protein  34.86 
 
 		 349 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000229864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  33.13 
 
 		 340 aa  61.6  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  30.95 
 
 		 293 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0585  integrase family protein  26.67 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  30.63 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  34.46 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  32.94 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0342  integrase family protein  29.81 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.39 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  30.98 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  28.21 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  30.59 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.87 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  31.36 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.1 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  33.33 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  30.05 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  32.95 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  30.77 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  31.28 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  34.34 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  34.15 
 
 		 306 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  30.43 
 
 		 290 aa  58.2  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 318 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 318 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.87 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  34.34 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  29.22 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  30.98 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  30.98 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.03 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.21 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  30.94 
 
 		 292 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  30.95 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  29.49 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  30.77 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.79 
 
 		 313 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  34.19 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 317 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  30.94 
 
 		 292 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  31.16 
 
 		 308 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  30.94 
 
 		 292 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  32.18 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.34 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  29.63 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  30.49 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  29.15 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  32.89 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  35.37 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0600  phage integrase family protein  31.09 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  33.54 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4323  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.980189 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  32.8 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.23 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  28.84 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  29.88 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  30.73 
 
 		 412 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  32.65 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  32.65 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  30.29 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  32.65 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  29.82 
 
 		 302 aa  55.1  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.44 
 
 		 322 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  31.9 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.82 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0113  resolvase  26.82 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189778 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  27.89 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  27.44 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 345 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0014  resolvase  27.93 
 
 		 277 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.921027  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0457  integrase family protein  30.3 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.093942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  32.28 
 
 		 360 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  29.35 
 
 		 345 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>