More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2790 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2790  TOBE domain-containing protein  100 
 
 		 438 aa  868    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  63.77 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  51.49 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  34.07 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3517  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  42.75 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  43.93 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2199  TOBE domain-containing protein  41.79 
 
 		 356 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3411  TOBE domain protein  37.25 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2367  phage integrase family protein  43.39 
 
 		 211 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.683007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2529  integrase family protein  36.22 
 
 		 218 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1780  TOBE domain protein  30.35 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.13 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.81 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.93 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0871  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.68 
 
 		 141 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180666  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  32.9 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.1 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.79 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.41 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  32.64 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  35.04 
 
 		 317 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  33.56 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.34 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.34 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.1 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.34 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 268 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.34 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.1 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.34 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.1 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.34 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.34 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  35.37 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.1 
 
 		 306 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.1 
 
 		 306 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 290 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  32.52 
 
 		 332 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  31.01 
 
 		 308 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.05 
 
 		 323 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 279 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  31.85 
 
 		 328 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.06 
 
 		 300 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  38.89 
 
 		 142 aa  53.5  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  31.52 
 
 		 343 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0342  integrase family protein  34.33 
 
 		 229 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  47.62 
 
 		 142 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  31.52 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.62 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  40.91 
 
 		 142 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  26.99 
 
 		 310 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  35.66 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.48 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  42.42 
 
 		 278 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.09 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  28.31 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  30.91 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  35.71 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2861  tyrosine recombinase XerD subunit  27.06 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.09 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 279 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  31.88 
 
 		 307 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.09 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  34.27 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  42.86 
 
 		 142 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  42.62 
 
 		 272 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  42.42 
 
 		 142 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  27.59 
 
 		 304 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  42.86 
 
 		 143 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0131  integrase family protein  31.65 
 
 		 312 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.144823 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  37.35 
 
 		 155 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.03 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  31.71 
 
 		 336 aa  51.6  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  32.74 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.12 
 
 		 302 aa  51.2  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  31.3 
 
 		 301 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 278 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  38.81 
 
 		 143 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 332 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  31.65 
 
 		 310 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  42.86 
 
 		 177 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0724  integrase family protein  36.99 
 
 		 308 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  32.19 
 
 		 303 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.65 
 
 		 317 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  35.53 
 
 		 306 aa  50.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2016  phage integrase family protein  33.1 
 
 		 333 aa  50.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  31.69 
 
 		 302 aa  50.4  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.93 
 
 		 298 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  29.93 
 
 		 298 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.54 
 
 		 298 aa  50.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.62 
 
 		 316 aa  50.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  31.58 
 
 		 295 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 254 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.69 
 
 		 345 aa  50.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.93 
 
 		 298 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>